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伯豪云流程新成員| mRNA分析云流程正式上線!

作者:上海伯豪生物技術(shù)有限公司 2024-12-06T00:00 (訪問量:31883)

既伯豪單細胞分析云流程上線之后,伯豪mRNA分析云流程也上線啦!

 

 

擺脫時空限制,隨心所欲玩轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘

伯豪m(xù)RNA分析云流程具備數(shù)據(jù)存儲,數(shù)據(jù)分析,數(shù)據(jù)交互,數(shù)據(jù)管理,數(shù)據(jù)下載功能,讓用戶能夠隨時隨地自主分析mRNA測序數(shù)據(jù),一鍵打包下載分析結(jié)果及報告。不用找人托人分析,不用等待分析人員回復(fù),更不用非得坐在實驗室,無論何時何地,只要登錄Hiplot平臺賬號,即可快速調(diào)整樣本分組方案,批量選擇分析內(nèi)容,也可隨心修改分析參數(shù)。剔除不合適樣本,調(diào)整分組比較,更換差異篩選閾值等分析從此擺脫依賴,擺脫時間,擺脫空間,隨時隨地想玩就玩!

 

系統(tǒng)功能齊全,分析內(nèi)容豐富

?支持項目概覽,批量修改,包括樣本名稱修改,分組信息調(diào)整,樣本刪減(通過勾選來確定納入分析的樣本),差異分析方法(edgeR,T Test, DEseq2),差異基因閾值(logFC,檢驗方法,Q value)調(diào)整等。此外,還可以實時關(guān)注調(diào)整后的分析進度。

?參數(shù)可調(diào)(分析參數(shù),繪圖參數(shù))

支持分析參數(shù)的調(diào)整和繪圖參數(shù)的調(diào)整,可對PCA,相關(guān)性熱圖,火山圖,熱圖,KEGG/GO富集圖等進行調(diào)整,調(diào)整后的結(jié)果會被記錄(以修改日期記錄),且可進行結(jié)果預(yù)覽和結(jié)果下載。

?可上傳文件進行特定圖片生成

在KEGG,GO,GSEA富集分析里,可支持上傳文件來進行作圖。這樣可以方便展示特定關(guān)注的pathway,GO terms和GSEA富集分析中基因集的富集情況。

此外,搭配伯豪生信云工具中已上架的20+mRNA相關(guān)小工具,進行WGCNA,趨勢分析,免疫浸潤分析,共表達分析等深入數(shù)據(jù)挖掘!

伯豪生信云網(wǎng)址:

http://tools.shbio.com/home/index.html

敲掉科研協(xié)作門檻,項目數(shù)據(jù)輕松管理與共享

科研協(xié)作是推進科研成果產(chǎn)出的重要過程,不知道大家平時怎么共享自己的科研數(shù)據(jù)呢?直接分享原始數(shù)據(jù)的話,不安全,傳輸慢,難以管控,實非首選。分享報告圖表的話,沒有中間數(shù)據(jù),一張張“死”圖表,無法改動,難以重現(xiàn),難以協(xié)作?;贖iplot云平臺,這些問題迎刃而解。項目數(shù)據(jù)可以一鍵分享,團隊多人共同協(xié)作,實時共享最新的數(shù)據(jù)分析結(jié)果及進度,而且所有分析過程都有留存,做到結(jié)果的真實可復(fù)現(xiàn)。這種“可共享、可編輯、可溯源”的云流程,著實省心省力。再也不用擔(dān)心找不到已畢業(yè)師兄師姐的項目數(shù)據(jù)了!

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