Parallel Reaction Monitoring(PRM,平行反應監測技術)是一種針對目標蛋白檢測的靶向質譜技術。通過對特異性肽段或目標肽段進行選擇性檢測,從而實現對目標蛋白質/修飾肽段的靶向相對或絕對定量,具有高特異性、高通量、無需抗體等優勢。相關應用解讀,詳情可點擊:與WB互補的驗證神器!6篇文獻一次解鎖『高通量靶向蛋白質檢測技術PRM』的魅力!
4D-PRM在普通的PRM的基礎上,利用離子淌度新一維的分離,提高了離子的選擇性和靈敏度,并結合了PASEF的掃描速度優勢,從而增加了靶標離子的數量。
自2022年推出4D-PRM蛋白質組學技術以來(詳情可點擊:4D-PRM新品| 吉凱靶向蛋白質組PRM技術全面升級,開啟4D-PRM新時代!),吉凱基因再次對4D-PRM蛋白質技術進行了優化,方法建立成功率高達90%,一次實驗可實現對100種蛋白質進行高通量驗證。
01
4D-PRM核心優勢一
4D-PRM預實驗可評價上千種蛋白質的方法建立成功率,成功率高達90%,絕大多數前組學差異結果均可通過4D-PRM驗證
4D-PRM技術是對前組學結果的驗證,但傳統的PRM技術往往只能成功建立部分差異蛋白的PRM檢測方法,因此這大大限制了PRM蛋白質組學技術的應用。此次吉凱基因對4D-PRM和4D-Label free蛋白質組學技術和流程進行了升級,例如:
1. 再也不用為怎么挑蛋白煩惱了:無需提前挑選正式實驗要檢測的蛋白質,可以等4D-PRM預實驗結果出來后再挑選。
2. 4D-PRM方法成功率高達90%:無論前期是480或timsTOF平臺上做的4D蛋白質組學,還是5D平臺上的蛋白質組學數據,均可采用4D-PRM靶向驗證,方法建立成功率在70~90%之間,平均在85%。
補充說明:目前無5D-PRM技術。因5D label free蛋白質組學技術檢測到的蛋白質比4D蛋白質組學多,所以4D-PRM技術對5D結果驗證時,方法建立成功率相比4D蛋白質組學有所下降,此為正常現象。

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4D-PRM核心優勢二
更快的采集速度,一次實驗可驗證多達100種蛋白
得益于timsTOF Pro大于120Hz的MS/MS掃描速度,此次吉凱對4D-PRM技術升級之后,使得PRM-PASEF能夠在短時間內可以同時定量多達100種蛋白質。相比傳統PRM一次只能驗證30種蛋白質而言,在相同分析時長下4D-PRM能以更快的掃描速度實現更多差異蛋白更高通量的驗證。

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4D-PRM核心優勢三
更高的離子選擇性,定量更準確
在timsTOF Pro上,4D-PRM因為有離子淌度的分離,具有更強的選擇性。離子過濾窗口(Ion Mobility Filter)處于關閉狀態時,相同質荷比的離子不能有效區分,離子選擇性弱。譜圖存在明顯的雜峰,定量準確性較低;相比之下,離子過濾窗口打開后,離子淌度能有效區分相同質荷比但形狀和截面不同的離子,顯著降低目標離子的背景,產生更強的離子選擇性和更高的定量準確性。


吉凱基因憑借多年在靶標篩選及驗證服務領域的技術積累,建立的標準化 、工程化 、系統化的GRP平臺,為中國研究型醫生提供科研服務,加快科研成果轉化。其中,多組學平臺包含蛋白質組學平臺和高通量測序平臺:
·蛋白質組學平臺擁有多臺timsTOF Pro、Exploris 480高精度質譜儀,專業的PaSER、Spectronaut Plusar等分析軟件,提供專業的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修飾組、olink蛋白質組等檢測服務,強大的機器學習算法、IPA分析、蛋白基因組分析服務,系統的生物標志物、分子分型、藥物靶點、基因功能研究等解決方案,真正讓廣大研究型醫生的科研工作更省心、更省力、更高效;
·高通量測序平臺分為常規測序服務和單細胞測序服務:單細胞測序擁有10x和BD兩個平臺,提供單細胞RNA-seq、單細胞核測序、單細胞混樣RNA-seq、單細胞TCR/BCR、單細胞(RNA+ATAC)、空間轉錄組測序等服務;常規測序服務提供meRIP-seq(m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修飾測序)、acRIP-seq(ac4C RNA乙酰化修飾測序)、ATAC-seq、Ribo-seq(翻譯組測序) 、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全轉錄組測序(兩文庫/三文庫)、外泌體miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服務。
