PCR (Polymerase Chain Reaction) 法是一種體外擴(kuò)增DNA的方法。因其操作簡(jiǎn)單,成本低,兼容性強(qiáng)等特點(diǎn),已成為分子生物學(xué)的基礎(chǔ)工具,應(yīng)用已滲透至生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域。
然而室溫下Taq DNA聚合酶具有殘留活性,會(huì)導(dǎo)致引物與模板非特異性結(jié)合,容易形成引物二聚體和錯(cuò)配的非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,進(jìn)而影響到目標(biāo)核酸的擴(kuò)增效率。
Hot Start PCR法的出現(xiàn)動(dòng)機(jī)源于解決常規(guī)PCR在室溫配制反應(yīng)體系時(shí)發(fā)生的非特異性擴(kuò)增問(wèn)題,其核心原理是通過(guò)溫度依賴性抑制DNA聚合酶活性,確保擴(kuò)增反應(yīng)僅在高溫下啟動(dòng)。
Hot Start PCR法的演化
通過(guò)物理、化學(xué)或生物手段在PCR循環(huán)前抑制DNA聚合酶活性,直至高溫激活階段釋放酶活,實(shí)現(xiàn)"低溫封鎖-高溫激活"的精準(zhǔn)控制,從而降低了非特異性擴(kuò)增,提高靶標(biāo)核酸的擴(kuò)增效率,降低假陽(yáng)性出現(xiàn)的概率。

圖示 不同的抑制酶活性的方案
階段1 早期手動(dòng)熱啟動(dòng)方案
早期的學(xué)者為了解決非特異擴(kuò)增的問(wèn)題,通過(guò)蠟層隔離酶和反應(yīng)液,然后通過(guò)高溫熔化使得試劑混合。存在耗時(shí),操作復(fù)雜,容易污染等問(wèn)題。
階段2 化學(xué)修飾
利用酸酐等化學(xué)小分子修飾DNA聚合酶上的賴氨酸殘基,從而在常溫下抑制DNA聚合酶的活性。存在高溫激活時(shí)間長(zhǎng)等問(wèn)題。
階段3 抗體修飾
單封閉抗體或雙封閉抗體會(huì)通過(guò)結(jié)合酶活性中心形成空間位阻抑制活性??贵w在PCR反應(yīng)初始熱激活步驟中變性并分離,從而使 Taq DNA 聚合酶發(fā)揮作用。由于抗體對(duì)熱極為敏感,因此抗體抑制酶的激活時(shí)間短,通常需要20s~5min即可完成。
階段4 適配體修飾
核酸適配體可逆結(jié)合酶活性中心位置抑制其功能??稍谙鄬?duì)較低的溫度進(jìn)行解離,釋放Taq酶活性。適配體修飾需依賴修飾核苷酸技術(shù)和高通量篩選平臺(tái),面臨篩選成本高,穩(wěn)定性差等挑戰(zhàn)。
綜上所述,Hot Start PCR法的誕生動(dòng)機(jī)直指常規(guī)PCR的室溫活性殘留問(wèn)題,其本質(zhì)是通過(guò)溫度依賴性開(kāi)關(guān)機(jī)制重塑酶活性的時(shí)空控制??傮w而言,熱啟動(dòng) DNA 聚合酶不僅廣泛應(yīng)用于傳染病領(lǐng)域,而且還廣泛應(yīng)用于其他行業(yè),例如法醫(yī)學(xué)、環(huán)境監(jiān)測(cè)或基因測(cè)試。
隨著分子診斷的不斷發(fā)展,引物探針全預(yù)混試劑以方便快捷的優(yōu)勢(shì)成為熱門(mén)需求。然而傳統(tǒng)Taq酶抗體原料通常僅封閉Taq酶的聚合活性,其5'-3'外切酶活性仍然暴露,導(dǎo)致與探針混合后,在低溫下仍發(fā)生探針切割釋放信號(hào),造成假陽(yáng)性的問(wèn)題。
為了解決上述問(wèn)題,近岸蛋白特別推出雙活性封閉的Taq酶抗體(目錄號(hào):Z088),與Taq DNA Polymerase 結(jié)合后,能夠同時(shí)高效封閉其5'→3'聚合酶活性和5'→3'外切酶活性,從而抑制低溫條件下由引物的非特異性退火引起的非特異性擴(kuò)增,和探針切割造成的假陽(yáng)性,從而支持引物探針、酶以及Buffer等全預(yù)混qPCR/qRT-PCR體系的搭建。
產(chǎn)品特點(diǎn)
1)高特異性:與Taq 酶親和力高,有效避免非特異性擴(kuò)增;
2)熱啟動(dòng)迅速:95 ℃、30s即可啟動(dòng)Taq酶活性;
3)支持全預(yù)混:可將除模板以外的所有組分預(yù)混成一管,使用便捷高效;
4)適用范圍廣:適配野生型及多種突變型Taq酶的封閉。
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產(chǎn)品性能
1 雙活性封閉性能優(yōu)
將帶有熒光標(biāo)記的模板分別與未封閉、單封閉抗體以及雙封閉抗體的Taq酶混合,50℃實(shí)時(shí)檢測(cè)熒光值變化。結(jié)果顯示,雙封閉抗體能夠很好的封閉Taq酶的5' - 3'聚合酶活性以及5' - 3'外切酶活性。同時(shí)使用雙封閉抗體,品牌A和品牌B同類產(chǎn)品分別封閉Taq DNA聚合酶,檢測(cè)封閉效果。結(jié)果顯示,近岸蛋白產(chǎn)品的封閉效果優(yōu)于品牌A和品牌B。


圖示1. 不同活性位點(diǎn)封閉效果測(cè)試

圖示2. 封閉效果驗(yàn)證
2 酶活釋放快
使用5U/ul 雙抗體封閉Taq DNA聚合酶,95℃下熱啟動(dòng)30s。結(jié)果顯示酶活釋放速度快,95℃,30 s即可釋放酶活,不影響后續(xù)擴(kuò)增。

圖示3. 酶活釋放效果測(cè)試
3 適配全預(yù)混
使用單封閉抗體,雙封閉抗體分別封閉Taq DNA聚合酶,混合ASFV的引物探針制備成全預(yù)混試劑,在37℃放置7d后,分別擴(kuò)增2000拷貝,200拷貝和20拷貝ASFV質(zhì)粒。結(jié)果顯示,雙封閉抗體全預(yù)混的基線更平穩(wěn),擴(kuò)增平臺(tái)值更優(yōu),且37℃穩(wěn)定性強(qiáng),與-20℃保存試劑擴(kuò)增無(wú)明顯差異。

圖示4. 不同抗體封閉的全預(yù)混效果測(cè)試
4 穩(wěn)定性強(qiáng)
使用熱加速破壞性試驗(yàn)測(cè)試雙封閉抗體的穩(wěn)定性。在37℃放置2d、5d、7d和14d,通過(guò)熒光法檢測(cè)發(fā)現(xiàn)雙封閉抗體(Z088)在14d封閉效果表現(xiàn)優(yōu)異,穩(wěn)定性更高。

圖示5. 雙封閉抗體穩(wěn)定性測(cè)試
5 適用范圍廣
使用雙封閉抗體分別封閉野生型和突變型TaqDNA 聚合酶,通過(guò)熒光法檢測(cè)封閉效果。結(jié)果顯示,對(duì)于不同類型的Taq酶,近岸蛋白雙封閉抗體封閉效果表現(xiàn)優(yōu)異。

圖示6. 雙封閉抗體適配不同類型的Taq酶
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