無參轉(zhuǎn)錄組高通量測序服務(wù)
隨著高通量測序的發(fā)展,越來越多的物種被測序。無參轉(zhuǎn)錄組是指在沒有參考基因組的情況下,對真核生物的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序,然后從頭組裝轉(zhuǎn)錄組(de novo transcriptome),進(jìn)行unigene的表達(dá),差異和功能注釋等分析,為深入研究該物種提供研究方向和思路。由于絕大部分已知物種是沒有參考基因組的
Cut&Tag測序服務(wù)
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation),是一種新興的蛋白質(zhì)-DNA互作研究方法。它利用帶有protein A-Tn5轉(zhuǎn)座酶的特異性抗體與目標(biāo)蛋白(例如,轉(zhuǎn)錄因子)原位結(jié)合,轉(zhuǎn)座酶激活后,切割目標(biāo)蛋白周圍的DNA,并連接測序結(jié)頭,產(chǎn)生測
piRNA-seq測序服務(wù)
piRNA(PIWI-interacting RNA),是一類長約25-33 nt的非編碼小RNA,它們通過與PIWI蛋白相互作用而發(fā)揮作用,在動物生殖細(xì)胞發(fā)育分化中發(fā)揮著重要作用。piRNA通過和PIW蛋白結(jié)合,與轉(zhuǎn)座子互補配對,以阻止轉(zhuǎn)座子表達(dá)。此外,PIWI蛋白也可能充當(dāng)致癌因子或抑癌因子。p
ChIP-seq測序服務(wù)
ChIP-seq(Chromatin immunoprecipitation followed by sequencing)使用抗體富集的方法在基因組范圍內(nèi)檢測多種蛋白(例如轉(zhuǎn)錄因子CTCF)和其他染色質(zhì)相關(guān)蛋白(例如H3K4me3)與DNA的相互作用。ChIP-seq用于研究表觀基因組如何促進(jìn)細(xì)胞
LncRNA-seq高通量測序服務(wù)
LncRNA是一類長度大于200 nt的非編碼RNA,通常認(rèn)為它們并不編碼蛋白質(zhì),而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等)參與mRNA基因的調(diào)控。作為新型疾病診斷和預(yù)后biomarker,越來越多研究者開始關(guān)注lncRNA,lncRNA在國自然中的資助也呈逐年上升趨勢
全轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)高通量測序服務(wù)
全轉(zhuǎn)錄組是指細(xì)胞轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA,包括mRNA和非編碼RNA。通常我們所說的全轉(zhuǎn)錄組測序通常包括對mRNA、lncRNA、circRNA和miRNA的測序。每種RNA分子可以單獨分析,也可以聯(lián)合分析,以更加全面地解析這些RNA分子的表達(dá)、差異,調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。由于測序成本的降低,越來越多的研究者開始選
mRNA-seq高通量測序(有參)
mRNA是由DNA的一條鏈作為模板轉(zhuǎn)錄,攜帶遺傳信息,并能指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的一類單鏈RNA。隨著增強核酸穩(wěn)定性和遞送系統(tǒng)等技術(shù)的發(fā)展,越來越多的mRNA技術(shù)產(chǎn)品從臨床試驗走向應(yīng)用,應(yīng)用范圍也不斷拓展。 mRNA測序使用oligo d(T)富集方法結(jié)合高通量測序研究mRNA的表達(dá)和調(diào)控,是幾乎所有研究的
circRNA-seq測序服務(wù)
circRNA是通過外顯子反式剪接(back splicing)形成的一類共價閉合環(huán)狀RNA,廣泛存在于哺乳動物細(xì)胞中。circRNA能夠抵抗RNA外切酶降解,因此比線性RNA更穩(wěn)定。它們可以通過(1)競爭結(jié)合miRNA充當(dāng)miRNA海綿,降低miRNA介導(dǎo)的基因表達(dá)調(diào)控的影響;(2)充當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)海綿
m6A MeRIP-seq測序分析服務(wù)
m6A甲基化修飾是指腺嘌呤的6號碳原子連接的氨基基團中的一個氫被甲基基團所取代。m6A甲基化是轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中重要的表觀遺傳修飾方式,普遍存在于真核生物中。MeRIP-seq高通量測序作為m6A修飾的檢測方法,能夠在全基因組范圍內(nèi)檢測m6A的存在。
miRNA-seq測序服務(wù)
miRNA是一類長約22 nt的非編碼小RNA。miRNA通過堿基互補配對結(jié)合到靶mRNAs 3’UTRs以調(diào)控數(shù)百個基因的表達(dá)。因此,miRNA參與幾乎所有生命活動,與生物體的生長、發(fā)育、疾病、衰老和死亡息息相關(guān),可以作為疾病診斷和檢測的biomarker,是經(jīng)久不衰的研究熱點。 mi
