人源細胞STR鑒定
產品名稱: 人源細胞STR鑒定
英文名稱: xibaosrejianding
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產品價格: 1000元/株
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細胞、組織身源認定或者個體識別是當今實驗數據及實驗數據準確性的重要內容。在DNA水平上進行個體同一認定是獲取準確結論的最直接方法。
?2011年初,美國菌種保藏中心(ATCC)制定了人源細胞系STR鑒定標準,旨在約束因細胞交叉污染和錯誤辨識所導致的無效科研數據的不斷擴增。更重要的是,細胞系的精確鑒定在研發基于細胞下的醫學產品時起到至關重要的作用,它能避免將人體細胞暴露于錯誤鑒定細胞中的風險。
目前應用最廣泛的技術是短串聯重復序列(short tandem repeat,STR)復合擴增熒光檢測技術。
細胞株STR鑒定目的:
(1)細胞系間有無交叉污染
(2)所培養細胞間是否同一來源
(3)細胞來源是否是人源
(4)細胞系是否發生轉化
(5)是否有跡象表明細胞系有無遺傳
(6)穩定傾向和表型多樣性的傾向
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STR分型是一種用來做親緣分析的方法,它的原理是在一單管中同時擴增多個多態性DNA片段。STR位點是由不同數目重復單元組成的重復DNA序列。每一個STR位點均能被擴增且擴增產物標記上不同顏色的熒光,使得擴增產物很容易通過片段大小和顏色來區分。
STR基因組是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA串聯重復序列,其核心序列長2-6BP,重復次數通常為15-30次。STR基因組的高度多態性及其在基因傳遞過程中遵循孟德爾共顯性遺傳規律等特點,使得PCR-STR復合擴增熒光檢測技術已成為國際法醫學界、真核生物學研究、企業藥物研發等領域不可或缺的一項重要技術手段,在各國罪犯DNA數據庫建設、細胞數據庫建設、人源個體識別,鼠源個體識別、種屬識別、親權鑒定等等實踐中發揮著越來越重要的作用
STR基因組由于其多態性主要源自核心序列重復次數在個體間的差異,因此利用STR可以有效進行細胞株鑒定。STR分型被ICLAC、ATCC、NIH等權威機構作為細胞株鑒定對的金標準
STR自動分型技術廣泛應用于DNA分型實驗,具有自動化程度高、快速、靈敏、準確、穩定、重復性好的特點。
目前已與國內近百所高校、科研院所及三甲醫院密切合作,并服務于多家生物醫藥生產企業。
實驗室中細胞處于下列情況時,則需要考慮進行細胞鑒定:
(1)當收到一株新的細胞株進實驗室時;
(2)某細胞株需要長期凍存時,提前做;
(3)從細胞庫復蘇后,確認是否為目標細胞株;
(4)細胞株傳代超過5-10代后;
(5)當研究數據出現異常,有疑問時;
(6)當研究開始或者結束時,對應研究的細胞株;
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公司堅持致力于細胞交叉污染及細胞溯源鑒定工作的研究,在細胞系STR鑒定方面具有豐富的經驗。針對包括但不限于干細胞、免疫細胞、PBMC、PDX模型、CDX模型、Car-t、iPSC細胞、類器官等不同類型樣本的不同鑒定要求,亦有2000+的檢測分析經驗。
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提供樣本類型:血漿,血清,細胞沉淀,細胞培養液,細胞凍存液,DNA,組織等(組織要大于芝麻粒大小;細胞大于等于106)
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一、STR鑒定實驗流程:
STR自動化分型技術主要步驟:多色熒光標記STR復合擴增,擴增產物自動毛細管電泳結合激光誘導的熒光檢測,自動數據采集并分型。
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1、取適量檢材,用Chelex100?法提取DNA;
2、采用CELL STR?ID?擴增20個STR位點和性別鑒定位點;
3、使用ABI 3130xl型遺傳分析儀進行PCR產物檢測;
4、使用GeneMapper IDX軟件(人源個體識別專用軟件)對檢測結果進行分析,并與ATCC、DSMZ、JCRB、ECACC、COG等全球近8000+個人源STR數據進行比對。
5、出具實驗報告,提供實驗報告給委托人及機構單位。
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二、數據分析詳情:
1、圖譜
有效峰為真實的PCR條帶;STUTTER峰及其它雜峰在分析時中忽略不計
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???1)STR分型結果說明:
(1)STR基因座結果只有一個數字(數字為該STR重復序列的重復次數),表示該基因座檢出2個一樣的分型條帶,為純合子;
(2)STR基因座結果有兩個不同數字,表示該基因座檢出2個不一樣的分型條帶,為雜合子。
2)STR分型圖譜說明:
(1)綠色橫條為對應的STR基因座名稱;
(2)各STR基因座位置的對應的灰色條帶為群體遺傳學分析統計的不同等位基因的標準品對應的片段長度;
(3)橫坐標為基因片段長度值范圍:圖譜顯示范圍一般為70b p-500bp;
(4)縱坐標為STR基因片段的信號強度,峰值越高表示當前檢測時的樣本相對濃度越高。(5)人正常二倍體細胞,各STR基因座檢出的正常STR圖譜應表現為單峰(純合子)或雙峰(雜合子)。
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例:樣本X-1細胞株的STR位點和Amelogenin位點的基因分型結果見附表:


