Pathway富集分析-基因芯片數據高級信息分析服務
產品名稱: Pathway富集分析-基因芯片數據高級信息分析服務
英文名稱: Pathway Enrichment
產品編號:
產品價格: 5250
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Pathway富集分析(Pathway Enrichment):
分析內容-對差異基因(P<0.05 或P<0.01 etc.)進行信號轉導通路分析:
a.提供差異基因(P<0.05或P<0.01)基因的所有信號通路(Pathway);
b. 富集分析前10個最重要信號轉導通路(Pathway),并提供信號轉導通路圖。
c. 信號轉導通路富集分析圖(熱圖Heatmap+聚類Cluster)
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信號轉導通路富集分析
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KEGG信號轉導通路
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Pathway富集分析可以歸納總結出芯片實驗數據的結果,顯示出某一生理過程所采用的信號傳遞途徑。
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通過差異基因的Pathway 分析,可以找到不同樣品間差異基因可能和哪些細胞通路的改變有關。通過芯片結果得到的是編碼這些蛋白質的mRNA 表達量的變化;從mRNA 到蛋白表達還要經過microRNA 調控,翻譯調控,翻譯后修飾(如糖基化,磷酸化),蛋白運輸等一系列的調控過程,mRNA 表達量和蛋白表達量之間往往不具有線性關系,因此mRNA 的改變不一定意味著蛋白表達量的改變。但Pathway富集分析的結果卻可以提示研究者蛋白的活性和表達量的變化。這為后期的蛋白活性驗證和蛋白表達量驗證均有不可估量的預示作用。在某些pathway 中,如EGFR/ERBB 通路,細胞可以在維持蛋白量不變的情況下,通過蛋白磷酸化程度的改變(調節蛋白的活性)來調節這條通路。所以芯片數據pathway 分析的結果需要有后期蛋白質功能實驗的進一步驗證,如采用流式細胞檢測細胞抗原、Western blot蛋白半定量檢測、Elisa激酶活性檢測,免疫組化(IHC),RNAi(RNA 干擾,miRNA)等技術手段做進一步深入的研究。
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