STR/SSR微衛星分型
產品名稱: STR/SSR微衛星分型
英文名稱: STR,SSR
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產品價格: 1000
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北京君諾德生物技術有限公司
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微衛星標記(Microsatellite)也稱為短串聯重復序列(STR)或簡單重復序列(SSR),是廣泛分布在真核生物基因組中的簡單重復序列。微衛星位點通常通過PCR擴增和電泳檢測,并根據片段大小分離等位基因進行分析;擴增后的等位微衛星可以用多種方法檢測,傳統方法采用聚丙烯酰胺凝膠電泳加放射顯影或銀染的方法,費時費力效率低。我們利用ABI遺傳分析儀對熒光標記的DNA片段進行檢測,結合分子量內標進行DNA片段長度計算,使STR分型變得高效快捷,結果也更加精確。
3.1 服務項目:
1.多態性引物開發:對于全基因組序列未知的物種,富集含SSR序列的DNA片段,開發出10-30條具有多態性的微衛星序列和引物。
2.多態性引物篩選:針對含微衛星的序列信息或引物和目標樣本,篩選出具有多態性的引物。
3.樣本批量擴增:用帶有熒光標記(FAM/HEX/TMR/ROX等)的引物,對批量樣本進行PCR擴增。我公司擁有高通量PCR儀平臺,可以滿足大量樣本擴增需求。
4.測序儀檢測:帶有熒光標記的PCR產物進行稀釋后與分子量內標混合,用3730xl等測序儀進行毛細管電泳,并得到原始數據。
5.原始數據分析:編制panel和bin等文件,使用正版GeneMapper v4.0軟件分析測序儀得到的fsa文件,并生成PDF圖譜和Excel文檔(包括size、基因分型等信息),分析后的電泳圖譜。
3.群體多態性研究:對于已篩選好的多態性引物和群體性樣本,進行批量檢測,并進行遺傳學分析。
3.2 送樣要求:
細胞(≥106 )、組織(≥300mg)、血液(≥1ml)、基因組DNA(≥20μl,濃度≥ 50ng/μl);引物信息、片段長度范圍、瓊脂糖電泳圖等。
3.3 提供結果:
?引物、微衛星分析的原始數據以及GeneMapper生成的PDF圖譜、包含片段長度等信息的Excel文檔和進一步的分析結果等。
