供應亞型分析及亞型特異基因發掘
產品名稱: 供應亞型分析及亞型特異基因發掘
英文名稱: MingYe Gene,Inc.
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| 對于定制芯片,由于基因數目相對于基因組芯片來說較少,所以可以在芯片原始數據z-score歸一化后,取所有基因作芯片方向的聚類分析。對于基因總數<2000的芯片,層次聚類等聚類算法可以有效地進行。 這樣可以直接將多張芯片歸入不同的組,即亞型。該實例的32張芯片中,28張芯片為糖尿病II型的,4張為糖尿病I型的。 |
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| ??????計算每個基因的信息熵,信息熵越大表明分子在各張芯片中的表達是一致的。而低信息熵基因則可能是亞型特異的(只在某種亞型中特異表達)。結合基因篩選算法,我們可以將這種基因查找出來作為該種亞型的簽名基因。我們找到3個II型糖尿病特異基因。 |
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