生物信息學(xué)分析
產(chǎn)品名稱： 生物信息學(xué)分析
英文名稱： Bioinformatics
產(chǎn)品編號(hào)： FAM1
產(chǎn)品價(jià)格： 0
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品牌商標(biāo)： null
更新時(shí)間： null
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基本分析： 1. 基因組學(xué)相關(guān)分析 1) 序列拼接，BAC及中小基因組組裝。 2) 序列比對(duì)，同源性搜索。 3) 多序列全局比對(duì)，同源進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建。 4) EST的基因組定位，可變剪切形式確定 。 5) Promoters預(yù)測(cè)與查找，CpG島，調(diào)控元件等。 6) 重復(fù)序列注釋：SSR,STR,LINE,SINE,Transposons等。 7) 基因預(yù)測(cè)及基因結(jié)構(gòu)分析：真核，原核，mRNA/cDNA編碼區(qū)預(yù)測(cè)。 8) Non-Coding RNA的預(yù)測(cè)與注釋： tRNA預(yù)測(cè)及二級(jí)結(jié)構(gòu)分析 rRNA預(yù)測(cè) MiRNA預(yù)測(cè)及結(jié)合靶點(diǎn)預(yù)測(cè) soRNA預(yù)測(cè)及甲基化位點(diǎn)預(yù)測(cè) 9) SNP分析。 10) 分子進(jìn)化相關(guān)分析：分歧年代，進(jìn)化樹(shù)，進(jìn)化壓力（Ka,Ks）。 11) EST序列/一般序列分析 序列基本分析：去除載體，污染，聚類，拼接 表達(dá)譜分析：特異表達(dá)基因，共調(diào)控基因 Unigene的功能注釋及分類（見(jiàn)下面基因注釋及功能分類） 基于EST的SNP分析 12) 基因的功能注釋及分類 NCBI非冗余核酸庫(kù)（NT） NCBI非冗余蛋白庫(kù)（NR） SwissProt蛋白數(shù)據(jù)庫(kù) Kegg Pathway數(shù)據(jù)庫(kù) COG/KOG蛋白家族數(shù)據(jù)庫(kù) Interpro&GO蛋白功能位點(diǎn)和結(jié)構(gòu)域（domain）數(shù)據(jù)庫(kù) 2. 蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)分析 1) 蛋白質(zhì)親/疏水性、等電點(diǎn)、抗原性分析及跨膜蛋白，信號(hào)肽等性質(zhì)分析和相似性分析 2) 蛋白級(jí)/三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 3. Microarray/Biochio生物芯片數(shù)據(jù)分析 1) 對(duì)基因芯片的表達(dá)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理與歸一化分析 2) 使用多種統(tǒng)計(jì)方法篩選具有顯著性差異表達(dá)的基因 3) 對(duì)差異表達(dá)基因數(shù)據(jù)進(jìn)行多種聚類分析，并給出樹(shù)狀圖 4) 結(jié)合基因GO分類(gene ontology)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)數(shù)據(jù)庫(kù)（KEGG），進(jìn)行相關(guān)路徑分析、差異表達(dá)基因的功能分類、所屬信號(hào)通路分類等 4. 引物/探針設(shè)計(jì) 1) 核酸引物、PCR引物、測(cè)序引物及雜交探針的設(shè)計(jì)與評(píng)價(jià) 2) 用于細(xì)菌種屬分類的雜交探針設(shè)計(jì) 3) 用于SNP檢測(cè)的探針設(shè)計(jì) 4) 芯片的olgio設(shè)計(jì)