三代測序/高通量測序:微生物測序/動植物基因組de novo測序/動植物基因組重測序/全長轉錄組測序/表觀基因組測序
產品名稱: 三代測序/高通量測序:微生物測序/動植物基因組de novo測序/動植物基因組重測序/全長轉錄組測序/表觀基因組測序
英文名稱: Third generation sequencing
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PacBio RSII測序系統,是基于單分子實時(Single Molecule Real Time, SMRT)DNA測序技術和納米微孔應用的革命性第三代測序平臺,可以在一天內完成從樣品制備到測序和讀取序列的全過程。
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【小基因組完成圖】
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第三代測序技術全面解決了二代測序海量數據拼接難、變異檢測假陽性高、稀有突變被淹沒、高GC含量區域無法跨越、高度片段無法準確測定等困擾,可以準確的實現細菌基因組完成圖的組裝,更加準確的檢測結構變異,同時還能檢測出全基因組、單堿基水平的表觀修飾信息。與一代測序、二代測序相比,三代測序技術具備明顯的優勢,已經成為小基因組領域行業“金標準”。

?? 小基因組de novo組裝方法

參考文獻:
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[1] Tisserant, Emilie, et al. Genome of an arbuscular mycorrhizal fungus provides insight into the oldest plant symbiosis.Proceedings of the National Academy of Sciences 110.50 (2013): 20117-20122.
【表觀基因組學】
與表觀遺傳學調控和DNA損傷相關的DNA堿基修飾(如甲基化)在多個生物過程中扮演了重要角色,包括生長和衰老、免疫、細菌致病性及疾病發展等。
毅新興業利用Pac Bio測序平臺,不需要額外實驗步驟,在測序同時能通過聚合酶動力學分析直接檢測多種堿基修飾,包括A的甲基化、C的甲基化、C的羥甲基化等。
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l? Pac Bio檢測堿基修飾原理:

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參考文獻:
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?[1] Murray, Iain A., et al. The methylomes of six bacteria. Nucleic acids research 40.22 (2012): 11450-11462.
【全長轉錄組】
目前常規的第二代測序技術普遍存在諸多局限性,毅新興業利用第三代測序平臺PacBio RS II,可以直接得到從5’端到3’端的高質量全長轉錄本信息,轉錄組不再需要組裝,所測即所得,從而高性價比地得到基因的全長isoforms序列,同時使得isoforms定量更加可信,大大縮短后續的應用分析時間。
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參考文獻:
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?[1] Shin SC,et al.Advantages of Single-Molecule Real-Time Sequencing in High-GC Content Genomes. PLoS One.?2013 Jul 23;8(7):e68824.
