差異表達趨勢分析
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英文名稱: 差異表達趨勢分析
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差異表達趨勢聚類分析
根據(jù)實驗設(shè)計和研究目的,選用專門處理時間序列實驗數(shù)據(jù)的算法根據(jù)基因隨時間發(fā)展的表達水平變化趨勢對基因進行聚類,每一類的基因具有相似的表達譜,這對研究共表達基因很有幫助。
差異表達趨勢分析可用來做處理時間、劑量變化、疾病亞型分型(sub-classification),也可用于檢測樣本群體分布情況,發(fā)現(xiàn)表達相關(guān)基因群等。常用的聚類方法有層次聚類(hierarchical cluster),K-means,自組織映射(SOM)。

