染色質免疫共沉淀測序(chip-seq)
產品名稱: 染色質免疫共沉淀測序(chip-seq)
英文名稱: chromatin immunoprecipitation assay, chip-seq
產品編號: yb012
產品價格: 8000
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染色質免疫共沉淀(ChIP)是在體內環境中研究蛋白質與DNA相互作用的經典實驗方法,廣泛應用于組蛋白修飾、特定轉錄因子的基因調控作用等相關領域。隨著新一代測序技術的發展和成熟,染色質免疫沉淀實驗與高通量測序的整合——Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP Sequencing ),可在全基因組范圍對蛋白結合位點進行高效而準確的篩選與鑒定,同時也為研究的深入開展打下基礎。
?? ? ? 采用特異性抗體對目的蛋白進行免疫沉淀后,分離與其結合的基因組DNA片段,再通過高通量測序與數據分析,在全基因組范圍內尋找目的蛋白的DNA結合位點,并且可以基于多個樣品進行差異比較。
技術優勢:
§? 檢測范圍廣:全基因組范圍的免疫沉淀與測序分析;
§? 高性價比:基于抗體富集目標區域,有效降低測序數據量;
§? 微量樣本:只需10 ng以上免疫沉淀后的DNA,即可進行測序分析。
研究內容:
一、標準信息分析?
1)???????? 去接頭污染,去低質量reads和產量情況統計;
2)???????? ChIP 測序序列與參考基因組序列的比對;
3)???????? ChIP 測序 Reads 在全基因組的分布;
4)???????? 統計ChIP測序數據富集區域 ( Peak ) 的信息;
5)???????? Peak相關基因篩選與GO功能聚類分析;
6)???????? 多個樣品的差異分析 ;
7)???????? UCSC Genome Browser使用說明;
二、高級信息分析
?不同表達水平的基因在TSS附近區域的 reads 富集程度。
三、定制化信息分析
可結合客戶的需求,協商確定定制化信息分析內容。?
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