染色質免疫共沉淀技術測序（chip-seq 組蛋白 轉錄因子）
產品名稱： 染色質免疫共沉淀技術測序（chip-seq 組蛋白 轉錄因子）
英文名稱： chip-seq
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? ? ? ?選擇百邁客技術平臺， ? 就是選擇科研成功之路！
? ? ? Chip-Seq的原理是：首先通過染色質免疫共沉淀技術（Chip）特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段，并對其進行純化與文庫構建，然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段信息。
數據分析
基本分析
對測序結果進行圖像識別（ Base calling ），去除污染及接頭序列；統計結果包括：測定的序列（ Reads ）長度、 Reads 數量、數據產量。
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高級分析
?1)ChIP-Seq 序列與參考序列比對；
?2) Peak calling ：統計樣品 Peak 信息（峰檢測及計數、平均峰長度、峰長中位數）；
?3) 統計樣品 Uniquely mapped reads 在基因上、基因間區的分布情況及覆蓋深度；
?4) 給出每個樣品 Peak 關聯基因列表及 GO 功能注釋；
?5) 在多個樣品間，對與 Peak 關聯基因做差異分析。
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? ? ? 由于 ChIP-Seq 的數據是 DNA 測序的結果，為研究者提供了進一步深度挖掘生物信息的資源，研究者可以在以下幾方面展開研究：
? ? ?1) 判斷 DNA 鏈的某一特定位置會出現何種組蛋白修飾；
?????2) 檢測 RNA polymerase II 及其它反式因子在基因組上結合位點的精確定位；
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?????3) 研究組蛋白共價修飾與基因表達的關系；
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?????4) CTCF 轉錄因子研究。
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