基因組文庫(kù)(Genomic Library)構(gòu)建
產(chǎn)品名稱: 基因組文庫(kù)(Genomic Library)構(gòu)建
英文名稱: Western Biotechnology Inc
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品牌商標(biāo): null
更新時(shí)間: 2023-07-31T09:56:51
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?基因組文庫(kù)(Genomic?Library)構(gòu)建
簡(jiǎn)介:
用限制性內(nèi)切酶切割細(xì)胞的整個(gè)基因組DNA,可以得到大量的基因組DNA片段,然后將這些DNA片段與載體連接,再轉(zhuǎn)化到細(xì)菌中去,讓宿主菌長(zhǎng)成克隆。這樣,一個(gè)克隆內(nèi)的每個(gè)細(xì)胞的載體上都包含有特定的基因組DNA片段,整個(gè)克隆群體就包含基因組的全部基因片段總和稱為基因組文庫(kù)。基因文庫(kù)=基因組文庫(kù)+cDNA文庫(kù)?。??
載體的種類和特征:
|
? |
受體細(xì)胞 |
結(jié)構(gòu) |
插入片段 |
舉例 |
|
質(zhì)粒 |
E.coli |
環(huán)狀 |
很小,<8kb |
pUC18/19?,T-載體,? |
|
λ噬菌體 |
E.coli |
線狀 |
9-24kb |
EMBL,λgt系列 |
|
絲狀噬菌體及噬菌粒 |
E.coli |
環(huán)狀 |
<10kb |
M13系列 |
|
粘粒載體 |
E.coli |
環(huán)狀 |
35-45kb |
? |
|
BAC |
E.coli |
環(huán)狀 |
約300kb |
? |
|
PAC |
E.coli |
環(huán)狀 |
100-800kb |
PCYPAC |
|
YAC |
酵母細(xì)胞 |
線性染色體 |
100-2000kb |
? |
|
MAC |
哺乳動(dòng)物細(xì)胞 |
環(huán)狀 |
>1000kb |
? |
|
病毒載體 |
動(dòng)物細(xì)胞 |
環(huán)狀 |
? |
SV40?載體,昆蟲桿狀病毒載體 |
|
穿梭載體 |
動(dòng)物細(xì)胞和細(xì)菌 |
環(huán)狀 |
? |
pSVK3質(zhì)粒,PBV,Ti質(zhì)粒, |
基因組文庫(kù)構(gòu)建步驟:
1、載體:?
l噬菌體:48.5kb,插入型(最多可容納9kb)、取代型(可容納?38-51kb,最適19-20kb),?EMBL,?Charon?粘性質(zhì)粒(Cosmid):4-6kb,?質(zhì)粒+噬菌體的性質(zhì),可容納大片段的外源基因,最多可容納46kb。?酵母人工染色體克隆體系(YAC,Yeast?Artificial?Chromosome??Cloning?System)?插入大小200—1000kb
2、?載體DNA的制備:?高分子量的外源DNA?100-150kb載體DNA酶切反應(yīng)-----載體臂的純化-----載體脫磷處理?(常用BamHI)???(蔗糖密度梯度離心)??(堿性磷酸酶)?
3、連接和包裝:外源片段與兩臂之間的比例,包裝蛋白?4、感染宿主菌:選擇合適的宿主菌,LE392,?NM538,?NM539,?KW251等?
5、基因組文庫(kù)的保存和擴(kuò)增:?
6、測(cè)滴度,要在106fu以上
7、保存:氯仿4℃,7%?DMSO?-70℃
您需要提供:?
動(dòng)物的血或細(xì)胞、新鮮植物葉片、活體昆蟲或純化好的DNA樣品。
我們提供:
1、文庫(kù)(10%甘油菌)以及菌落效價(jià)(CFU/ml);
2、隨機(jī)抽樣測(cè)序結(jié)果。
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