環狀RNA芯片技術服務
產品名稱： 環狀RNA芯片技術服務
英文名稱： circRNA microarray sevice
產品編號：
產品價格： 請詢價400-886-5058；800-820-5058
產品產地： null
品牌商標： null
更新時間： 2023-09-21T16:15:32
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?? ?環狀RNA芯片技術服務
? ? ?環狀RNA（circRNA）是一類由特殊剪接機制形成的、具有閉合環狀結構、大量存在于真核轉錄組中的非編碼RNA；也是目前生命科學和醫學領域的研究熱點分子。circRNA分子的組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩定性等特征，使得circRNA作為臨床疾病的biomarker具有明顯的優勢。近來研究顯示，環狀RNA在不同物種中起到miRNA海綿的作用，稱之為競爭性內源RNA（ceRNA），即能競爭性結合miRNA。而與疾病關聯性miRNA的相互作用說明環狀RNA對疾病的調控起著非常重要的作用。此外，一些內含子類型的環狀RNA（ciRNA）會促進宿主基因的轉錄。
??? 為了能夠更好地研究circRNA，美國Arraystar公司在全球首款circRNA芯片基礎上迅即升級版本為V2.0。其circRNA來源融合了環狀RNA研究的最新頂尖文獻，所有cicrRNA都經過了嚴謹的實驗驗證，以便于對不同生理及病理條件下的circRNA進行系統的研究。同時我們對所有差異表達的circRNA用高匹配值的miRNA靶標位點進行了標注，這將有利于對circRNA作為天然miRNA海綿功能的進行研究。
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康成生物是Arraystar公司中國地區唯一代理商，為您提供一站式circRNA芯片技術服務，您只需要提供保存完好的組織或細胞標本，康成的技術服務人員就可為您完成全部實驗操作，并提供完整的實驗報告。 |
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服務 |
芯片 |
規格 |
描述 |
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Human Circular RNA ?Array Service |
NEW??Human Circular RNA Array V2.0 |
8 × 15K |
13,617 Human circular RNAs |
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Mouse Circular RNA ?Array Service |
NEW??Mouse Circular RNA Array V2.0 |
8 × 15K |
14,236?Mouse circular RNAs |
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Rat Circular RNA ?Array Service |
NEW??Rat Circular RNA Array V2.0 |
8 × 15K |
14,145 Rat circular RNAs? |
*圖釋：詳細的circRNA注釋：1）與circRNA對應的線性mRNA信息；2）circRNA上匹配度比較好的保守miRNA的結合位點。
circRNA高通量篩選的利器：RNA-seq or microarray？
*圖釋：定量可靠的轉錄本比例與測序深度關系圖。RNA測序一般產生低于30M mRNA reads（藍圈），低于0.5M circular junction reads（紅圈），真正得到有效檢測的circular junctions低于5%。（Adopted from Labaj et al, (2011) Bioinformatics [PMID 21685096].）
康成生物環狀RNA芯片技術服務主要實驗流程
??? 1.?樣品RNA抽提
?? ??實驗對象為組織樣品，取適量（50-100mg）新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品，加1ml的RNA抽提試劑TRIzol（Invitrogen），勻漿后抽提RNA。
?? ??實驗對象為細胞樣品，每份樣品取1×106～1×107細胞，完全吸去培養液后加1ml的RNA抽提試劑TRIzol，裂解后抽提RNA。
??? 2.? RNA質量檢測
? ??使用Nanodrop測定RNA 在分光光度計260nm、280nm和230nm的吸收值，以計算濃度并評估純度。
? ??用甲醛電泳試劑進行變性瓊脂糖凝膠電泳，檢測RNA純度及完整性。
? ??提供RNA QC報告。
??? 3.?RNase R處理
??? 4.?cDNA/aRNA樣品合成和標記
??? 5.?標記效率質量檢測
? ??使用Nanodrop檢測熒光標記效率，標記效率合格以保證后續芯片實驗結果的可靠性。
??? 6.?芯片雜交
? ??在標準條件下將標記好的探針和高密度基因組芯片進行雜交。
??? 7.?圖像采集和數據分析
? ??使用GenePix 4000B芯片掃描儀掃描芯片的熒光強度，并將實驗結果轉換成數字型數據保存，使用配套軟件對原始數據進行分析運算。
??? 8.?提供實驗報告：
? ??Scanning Image: Cy3熒光掃描圖像；
? ??Scatter Plot: 散點圖，X軸為Control信號值，Y軸為Experiment信號值，表示信號數據總體分布趨勢；
? ??Raw Data: 探針的掃描熒光信號強度原始數據；
? ??Normalized Data: 經過統計學方法標準化后數值；
? ??P–value: T-test統計分析顯著差異表達的基因，p-value越小，該circRNA在兩組樣本間差異表達越顯著；
? ??Significant Up & Down Regulated CircRNA List: 顯著差異表達的circRNA列表包含Fold Change, p-value以及circRNA的詳細注釋信息（相應的線性mRNA和miRNA結合位點）。
康成客戶實例——Arraystar環狀RNA芯片
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