ATAC-seq高通量測序數據分析
產品名稱： ATAC-seq高通量測序數據分析
英文名稱： ATAC-seq
產品編號： ATAC
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更新時間： 2023-11-30T00:11:20
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ATAC-seq（Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughput sequencing）是結合高通量測序技術的靶向開放染色質的研究方法。該方法由斯坦福大學的 William J. Greenleaf 和Howard Y. Chang在2013年共同開發。在 ATAC-seq 實驗中，通過高活性 Tn5 轉座酶將測序接頭插入染色質的開放區域，然后進行測序，通過測序數據推斷染色質區域的可及性，并可以計算轉錄因子結合位點和核小體的區域位置等。
問組生物ATAC分析主要包括：
1.原始數據質控
2.片段長度分布質控
3.樣品相關性
4.富集峰鑒定和注釋
5.富集峰長度分布
6.TSS周圍reads分布熱圖
7.Motif分析
8.差異分析
9.GO富集分析
10.KEGG通路富集分析
11.可視化