轉錄組測序(RNA-seq)
產品名稱: 轉錄組測序(RNA-seq)
英文名稱: a
產品編號:
產品價格: 詢價
產品產地: null
品牌商標: null
更新時間: null
使用范圍: null
- 聯系人 :
- 地址 : 杭州數字信息產業園D座301
- 郵編 : 310058
- 所在區域 : 浙江
- 電話 : 133****8502 點擊查看
- 傳真 : 點擊查看
- 郵箱 : service@guheinfo.com
轉錄組研究是基因功能及結構研究的基礎和出發點,利用Illumina大規模測定mRNA序列獲得轉錄本信息,該技術具有通量高、覆蓋范圍廣、精度高等特點。其不依賴于基因組參考序列,使所有生物都可以成為研究對象,同時能夠在全基因組范圍內檢測真核細胞中廣泛存在的可變剪切現象,為轉錄本的結構研究、基因轉錄水平研究、全新轉錄區域研究等提供重要的研究工具。通過Illumina新一代高通量測序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態下的幾乎所有轉錄本及基因序列,已廣泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。
技術路線:

分析流程:

結果案例:

無參考基因組RNA-seq分析

Trinity拼接Contig長度分布

韋恩圖

GO功能分布圖

COG功能分布圖

有參考基因組RNA-seq分析

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?兩兩樣本之間表達量的分布圖,較對角線離散意味著表達差異越大

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 樣本差異基因表達量的聚類圖

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 樣本表達分布

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 表達模式聚類圖
服務說明:
樣品濃度≥200ng/ul,OD260/280為1.8-2.2,總RNA含量≥20ug(qibit檢測為準),干冰運輸
參考文獻:
1、Fan H,?et al. Deep?Sequencing-Based?Transcriptome Profiling?Reveals Comprehensive?Insights
?into the Responses?ofNicotiana?benthamiana?to?Beet?necrotic?yellow?vein?virus?Infections?
Containing?or?Lacking?RNA4. PLoS One.?2014;9(1):e85284.
2、Wang XC,?et al. Global?transcriptome?profiles of?Camellia?sinensis?during?cold?acclimation. BMC Genomics.?2013;14:415.
?
3、Zhai R,?et al. Transcriptome?analysis?of?rice?root?heterosis?by?RNA-Seq.BMC Genomics.?2013;14:19.
?
