tRNA測序
產品名稱： tRNA測序
英文名稱： tRNA測序
產品編號：
產品價格： 咨詢：021-64878766
產品產地： null
品牌商標： null
更新時間： null
使用范圍： null
- 聯系人 : 劉晴晴
- 地址 : 上海市松江區莘磚公路518號24號樓4樓
- 郵編 :
- 所在區域 : 上海
- 電話 : 137****8490 點擊查看
- 傳真 : 點擊查看
- 郵箱 : market@cloud-seq.com.cn;liuqingqing@cloud-seq.com.cn
技術簡介
轉運RNA(tRNA)是一類具有攜帶并轉運氨基酸功能的非編碼小RNA。tRNA除了參與蛋白合成外，還參與調控多種生理病理過程。最新研究表明：tRNA能通過多種機制調控基因的表達，與腫瘤、代謝疾病、神經退行性疾病甚至病毒感染等重大疾病的發生發展息息相關。
成熟tRNA豐富的轉錄后修飾和二級結構都限制了傳統RNA-seq的加接頭和cDNA合成效率，云序生物的tRNA測序可以有效地去除tRNA的內部修飾和末端修飾，使得tRNA測序獲得更高的檢測效率和更高的精準度，防止信息的丟失，為客戶提供完整的測序報告。
tRNA-seq流程圖
云序優勢
高檢測效率和高精準度：
有效去除tRNA甲基化修飾和末端修飾，使tRNA-seq具有高檢測效率和高精準度。
系統性服務：
系統性提供tRNA測序、tiRNA和tRF測序、tRNA m5C甲基化測序等tRNA相關產品服務。
數據全面：
最權威的tRNA數據庫，全面的tRNA表達譜分析。
專業的生物信息學分析：
云序生物具有強大的生物信息學團隊，能夠滿足客戶的各類深入數據分析要求。
樣本要求
樣品類型：
組織、細胞、體液或RNA樣品。其它類型樣品請詳詢。
樣品量：
a) 細胞：2×107
b) 組織：100 mg
c) 體液：全血、血清、血漿2-3 ml
腦脊液：5 ml
尿液：50 ml
d) 總RNA：2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5; 無明顯降解，電泳檢測樣品特征性條帶完整清晰，無明顯彌散或拖尾)?
樣品運輸及保存：
樣品運輸：樣品置于1.5mL管中，封口膜封好，干冰運輸?
樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊，可用TRIZOL或RNA保護劑處理，液氮凍存后，-80℃保存，RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存，樣品保存期間避免反復凍融。?
數據分析
1、tRNA長度統計圖
2、tRNA散點圖
3、差異表達的tRNA聚類分析
4、編碼tRNA基因啟動子motif分析
5、反密碼子分析
案例解析
案例1：tRNA促進乳腺癌轉移
原文：Modulated Expression of Specific tRNAs Drives Gene Expression and Cancer Progression
期刊：Cell 影響因子：31.39
本文通過tRNA測序和嚴謹的生物信息學分析，發現高轉移性乳腺癌細胞亞株MDA-LM2與CN-LM1a中某些特異性tRNA水平上調會使細胞獲得轉移能力。通過相應實驗證實，tRNA GluUUC與tRNA ArgCCG是乳腺癌轉移的助推因子。tRNA GluUUC與tRNA ArgCCG的上調會增加轉錄本穩定性及轉錄本與核糖體的結合力，這一調控作用具有密碼子特異性。特別是tRNA GluUUC可通過直接增強下游靶基因EXOSC2和GRIPAP1表達進而形成一條受tRNA驅動的“可誘導”通路，從而促進乳腺癌的轉移。
圖1. 不同細胞中差異表達的tRNA，特異性tRNA與轉移乳腺癌細胞的相關性