16s/宏基因測(cè)序服務(wù)

內(nèi)容簡(jiǎn)介

16S/18S rDNA分別是編碼原核/真核細(xì)胞核糖體小亞基的DNA序列，而真菌18S、5.8S和28S rDNA基因間隔序列稱為ITS，ITS分為兩個(gè)區(qū)域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間，ITS2位于5.8S和28S之間。細(xì)菌的16S rDNA，真核微生物的ITS或18S rDNA序列，既有結(jié)構(gòu)與功能上的高度保守性，又有種屬間高變性的特征，非常適合研究環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)組成、挖掘樣品間微生物差異、研究其物種多樣性。

環(huán)境微生物多樣性檢測(cè)是指通過(guò)對(duì)環(huán)境中微生物的16S rDNA 、18S rDNA或ITS高變區(qū)的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序并分析該環(huán)境下微生物群落的多樣性及特征，因此微生物擴(kuò)增子測(cè)序又被稱為微生物多樣性測(cè)序。常用于疾病與人體腸道、表皮微生物的關(guān)系研究，腸道、瘤胃（如產(chǎn)甲烷菌類(lèi)群）與動(dòng)物健康/營(yíng)養(yǎng)消化的研究等領(lǐng)域。

宏基因組學(xué)（Metagenomics），利用新一代高通量測(cè)序技術(shù)（NGS）以特定環(huán)境下微生物群體基因組為研究對(duì)象，在分析微生物多樣性、種群結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系的基礎(chǔ)上，可進(jìn)一步探究微生物群體功能活性、相互協(xié)作關(guān)系及與環(huán)境之間的關(guān)系，發(fā)掘潛在的菌群基因功能意義。與傳統(tǒng)微生物研究方法相比，宏基因組測(cè)序技術(shù)規(guī)避了絕大部分微生物不能培養(yǎng)、痕量菌無(wú)法檢測(cè)的缺點(diǎn)，因此近年來(lái)在微生物學(xué)各個(gè)領(lǐng)域研究中得到了廣泛應(yīng)用。

技術(shù)原理

16S/18S/ITS擴(kuò)增子測(cè)序，首先提取樣本全基因組DNA，使用特異性引物擴(kuò)增出目標(biāo)區(qū)域序列，構(gòu)建文庫(kù)后使用Illumina Hiseq2500進(jìn)行PE250測(cè)序，從而獲得目標(biāo)區(qū)域的序列數(shù)據(jù)信息。

宏基因組測(cè)序，提取樣本全基因組DNA，片段化后制備300bp測(cè)序文庫(kù)，然后使用Illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序，從而獲得全部的微生物基因組序列數(shù)據(jù)信息。

技術(shù)優(yōu)勢(shì)