生物樣本STR種屬鑒定及交叉污染檢測
產品名稱： 生物樣本STR種屬鑒定及交叉污染檢測
英文名稱： zhongshujianding
產品編號：
產品價格： 1800
產品產地： null
品牌商標： null
更新時間： null
使用范圍： null
- 聯系人 :
- 地址 : 吳中區郭巷街道吳淞江路1號天運廣場5棟首科醫谷1909室
- 郵編 :
- 所在區域 : 江蘇
- 電話 : 180****7867 點擊查看
- 傳真 : 點擊查看
- 郵箱 : strjiance@126.com
細胞、組織身源認定或者個體識別是當今實驗數據及實驗數據準確性的重要內容。在DNA水平上進行個體同一認定是獲取準確結論的最直接方法。
目前應用最廣泛的技術是短串聯重復序列（short tandem repeat,STR）復合擴增熒光檢測技術。
細胞株STR鑒定目的：
（1）細胞系間有無交叉污染
（2）所培養細胞間是否同一來源
（3）細胞來源是否是人源
（4）細胞系是否發生轉化
（5）是否有跡象表明細胞系有無遺傳
（6）穩定傾向和表型多樣性的傾向
?
STR基因組是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA串聯重復序列，其核心序列長2-6BP，重復次數通常為15-30次。
STR基因組的高度多態性及其在基因傳遞過程中遵循孟德爾共顯性遺傳規律等特點，使得PCR-STR復合擴增熒光檢測技術已成為國際法醫學界、真核生物學研究、企業藥物研發等領域不可或缺的一項重要技術手段。
在各國罪犯DNA數據庫建設、細胞數據庫建設、人源個體識別，鼠源個體識別、種屬識別、親權鑒定等等實踐中發揮著越來越重要的作用
STR基因組由于其多態性主要源自核心序列重復次數在個體間的差異，因此利用STR可以有效進行細胞株鑒定。STR分型被ICLAC、ATCC、NIH等權威機構作為細胞株鑒定對的金標準
STR自動分型技術廣泛應用于DNA分型實驗，具有自動化程度高、快速、靈敏、準確、穩定、重復性好的特點。
常用的STR自動化分型技術主要步驟：多色熒光標記STR復合擴增，擴增產物自動毛細管電泳結合激光誘導的熒光檢測，自動數據采集并分型。
?
實驗室中細胞處于下列情況時，則需要考慮進行細胞種屬鑒定:
(1)當收到一株新的細胞株進實驗室時，需要確認細胞品種屬時；
(2)某細胞株長期與不同種屬細胞共同凍存時；
(3)從細胞庫復蘇后，對目標細胞株；
(4)細胞株傳代超過5-10代后；
(5)當研究數據出現異常，有疑問時；
(6)當研究開始和結束時，需要對我們研究的細胞株
......
?
?
種屬STR鑒定采用種屬基因分型試劑盒，有效替代同工酶檢測，單次檢測即可確認種屬及種屬交叉污染情況。實現了人、小鼠、大鼠、倉鼠、猴、兔、豬、狗、牛、羊等10個種屬某個特定種屬的認定分型圖譜，準確的數據與峰圖確定其所含種屬。確定細胞株種屬的同時，也可監控是否有其他種屬的交叉污染。
提供樣本類型：血漿，血清，細胞沉淀，細胞培養液，細胞凍存液，DNA，組織等(組織需要大于芝麻粒大小；細胞大于等于106）
?
一、生物種屬STR鑒定試驗流程：
?
1、樣本提供：細胞株細胞105-106個；組織樣本（至少芝麻粒大小，加冰袋運輸）；
2、取適量檢材用Chelex100?提取DNA；
3、取適量該樣本?DNA?用種屬熒光復合引物?MIX?對動物線粒體?COI?基因進行擴增（參考文獻：Species?identification?in?cell?culture:?a two-pronged molecular approach，In Vitro Cellular & Developmental—Animal (2007)其中包括人、小鼠、大鼠、倉鼠、猴、兔、豬、狗、牛、羊等10個種屬生物樣本特異性引物；
4、使用ABI 3130XL型遺傳分析儀上對擴增產物進行檢測；
5、使用GeneMapper IDX軟件(Applied Biosystems)對檢測結果進行分析，
6、審核實驗報告，提供實驗報告給委托人或者企業單位。
?
二、STR分型圖譜說明：
種屬復合擴增MIX表
1-MO | 小鼠 | 10-18S | 18S內參 | 19-CR | 中國地鼠 |
2-AF | 綠猴 | 11-SS | 豬 | ? | ? |
3-OR | 穴兔 | 13-OA | 綿羊 | ? | ? |
4-RA | 大鼠 | 14-CF | 狗 | ? | ? |
5-HO | 人 | 16-bt | 牛 | ? | ? |
?
樣本“樣本ZS-2”的COI基因擴增產物，毛細管電泳圖譜如下：
注: 內參基因: 18S; 人源特異引物: 5-HO
?
（1）綠色橫條為對應的STR基因座名稱；
（2）各STR基因座位置的對應的灰色條帶為群體遺傳學分析統計的不同等位基因的標準品對應的片段長度；
（3）橫坐標為基因片段長度值范圍：圖譜顯示范圍一般為70b p-500bp；
（4）縱坐標為STR基因片段的信號強度，峰值越高表示當前檢測時的樣本相對濃度越高。