Taqman探針合成
產(chǎn)品名稱: Taqman探針合成
英文名稱: Taqman Taqman-MGB
產(chǎn)品編號: rc-7
產(chǎn)品價格: 0
產(chǎn)品產(chǎn)地: null
品牌商標: null
更新時間: 2023-09-21T16:12:32
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1,合成原理
??? DNA通過固相亞磷酰胺三酯法合成:溶液中的亞磷酰胺單體通過縮合反應形成3′--5′磷酸二酯鍵,連接到固相載體(CPG或樹脂)上。并依次延伸,直到序列的最后一個5′堿基連接上后合成結束。整個合成過程儀器自動完成,每個循環(huán)分為脫保護、活化、偶合、蓋帽(封閉)、氧化五個步驟。
??? 第一步:脫保護(Deblocking):用三氯乙酸(TCA)去除CPG所鏈核苷上的DMT保護基團,暴露5′羥基,供下一步縮合。??? 第二步:活化(Activation):單體與催化劑四唑混合進入合成柱,四唑轉移一個質子給3′亞磷酸上二異丙胺基的N原子,質子化的氨是四唑親核進攻的離去基團,二異丙酰胺被四唑取代,形成亞磷酰胺-四唑活性中間體。
??? 第三步:偶合(Coupling):亞磷酰胺-四唑中間體與CPG所連接的核苷酸的5′羥基發(fā)生縮合反應,縮合脫掉四唑,形成延長一個堿基的核苷酸鏈。
????第四步:蓋帽(Capping):少量未反應(2%)的載體上的核苷酸鏈的5′羥基會在后續(xù)的循環(huán)中參加反應,生成少一個堿基的核苷酸鏈,因此需要在反應后進行封閉。常用乙?;磻c5′羥基縮合成酯鍵,一般用混合乙酸酐和N-甲基咪唑等做乙?;噭?。????第五步:氧化(Oxidation):偶合反應形成的三價亞磷酸酯鍵很不穩(wěn)定,因此要用氧化劑——碘的四氫呋喃溶液將三價磷氧化成穩(wěn)定的五價磷。依此步驟循環(huán),最終得到一個全長DNA粗品 。
??? 探針合成需要在3末端任意加一個堿基,合成結束后根據(jù)不同標記連接不同試劑。
??? 用新鮮的濃氨水把粗品從載體上切割下來,采用適當?shù)募兓绞饺コ唐魏桶被摫Wo及乙基脫保護形成的鹽離子。
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?2,純化原理 ?? 目前慣用的純化方式主要有4種: OPC純化、 PAGE 純化、脫鹽純化、 HPLC純化,洛成除特別要求,一般都采用PAGE 純化
??? 利用DNA不同片段在膠中遷移率不同而分離,大片段電荷多,分子大,遷移的速度慢。等目的片段與N-片段分開后切下目的片段,80℃孵育2小時后脫鹽。
??? 優(yōu)點:分離效果好,純度能達到98-99%,可以滿足測序、克隆等用。引物也很穩(wěn)定。
??? 缺點:比較費時費力,樣品損失很大。
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3, Taqman-MGB探針一般用于SNP檢測,也用于Realtime-PCR檢測,較普通Taqman探針可以使探針的長度縮短,?提高配對與非配對模板間的Tm值差異,信噪比更高;?