eccDNA-seq高通量測序分析
產品名稱: eccDNA-seq高通量測序分析
英文名稱: eccDNA-seq
產品編號: eccDNA
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更新時間: 2023-11-30T00:09:54
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上海問組生物科技有限公司
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染色體外環狀DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)廣泛存在于真核生物細胞中,它們游離于染色體基因組之外,由基因組分離或脫落形成。eccDNA長度從幾十bp到幾十萬bp。人們發現腫瘤細胞中存在大量eccDNA,且攜帶原癌基因,可以通過增加癌基因的表達促進腫瘤發生。此外,eccDNA還與耐藥、衰老、腫瘤異質性、細胞間交流等功能相關。eccDNA已經成為生命科學領域新的研究熱點。
eccDNA測序結合環狀DNA富集,滾環擴增和高通量測序技術檢測并定量樣品中的eccDNA,為eccDNA在疾病中的功能研究奠定基礎。
問組生物eccDNA分析內容包括:
1,原始數據質控
2,eccDNA鑒定和注釋
3,eccDNA長度分布
4,差異eccDNA
5,eccDNA來源基因的GO富集分析
6,eccDNA來源基因的KEGG通路富集分析
7,eccDNA染色體分布
8,可視化
