小鼠細(xì)胞STR鑒定
產(chǎn)品名稱： 小鼠細(xì)胞STR鑒定
英文名稱： xiaoshuxibaojianding
產(chǎn)品編號：
產(chǎn)品價格： 1000元/株
產(chǎn)品產(chǎn)地： null
品牌商標(biāo)： null
更新時間： null
使用范圍： null
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- 地址 : 吳中區(qū)郭巷街道吳淞江路1號天運(yùn)廣場5棟首科醫(yī)谷1909室
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- 所在區(qū)域 : 江蘇
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細(xì)胞、組織身源認(rèn)定或者個體識別是當(dāng)今實驗數(shù)據(jù)及實驗數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性的重要內(nèi)容。在DNA水平上進(jìn)行個體同一認(rèn)定是獲取準(zhǔn)確結(jié)論的最直接方法。
?2011年初，美國菌種保藏中心（ATCC）制定了人源細(xì)胞系STR鑒定標(biāo)準(zhǔn)，旨在約束因細(xì)胞交叉污染和錯誤辨識所導(dǎo)致的無效科研數(shù)據(jù)的不斷擴(kuò)增。更重要的是，細(xì)胞系的精確鑒定在研發(fā)基于細(xì)胞下的醫(yī)學(xué)產(chǎn)品時起到至關(guān)重要的作用，它能避免將人體細(xì)胞暴露于錯誤鑒定細(xì)胞中的風(fēng)險。
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目前應(yīng)用最廣泛的技術(shù)是短串聯(lián)重復(fù)序列（short tandem repeat,STR）復(fù)合擴(kuò)增熒光檢測技術(shù)。
細(xì)胞株STR鑒定目的：
（1）細(xì)胞系間有無交叉污染
（2）所培養(yǎng)細(xì)胞間是否同一來源
（3）細(xì)胞來源是否是人源
（4）細(xì)胞系是否發(fā)生轉(zhuǎn)化
（5）是否有跡象表明細(xì)胞系有無遺傳
（6）穩(wěn)定傾向和表型多樣性的傾向
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STR基因組是一類廣泛存在于真核生物基因組中的DNA串聯(lián)重復(fù)序列，其核心序列長2-6BP，重復(fù)次數(shù)通常為15-30次。STR基因組的高度多態(tài)性及其在基因傳遞過程中遵循孟德爾共顯性遺傳規(guī)律等特點(diǎn)，使得PCR-STR復(fù)合擴(kuò)增熒光檢測技術(shù)已成為國際法醫(yī)學(xué)界、真核生物學(xué)研究、企業(yè)藥物研發(fā)等領(lǐng)域不可或缺的一項重要技術(shù)手段，在各國罪犯DNA數(shù)據(jù)庫建設(shè)、細(xì)胞數(shù)據(jù)庫建設(shè)、人源個體識別，鼠源個體識別、種屬識別、親權(quán)鑒定等等實踐中發(fā)揮著越來越重要的作用
STR基因組由于其多態(tài)性主要源自核心序列重復(fù)次數(shù)在個體間的差異，因此利用STR可以有效進(jìn)行細(xì)胞株鑒定。STR分型被ICLAC、ATCC、NIH等權(quán)威機(jī)構(gòu)作為細(xì)胞株鑒定對的金標(biāo)準(zhǔn)
STR自動分型技術(shù)廣泛應(yīng)用于DNA分型實驗，具有自動化程度高、快速、靈敏、準(zhǔn)確、穩(wěn)定、重復(fù)性好的特點(diǎn)。
目前已與國內(nèi)近百所高校、科研院所及三甲醫(yī)院密切合作，并服務(wù)于多家生物醫(yī)藥生產(chǎn)企業(yè)。
實驗室中細(xì)胞處于下列情況時，則需要考慮進(jìn)行細(xì)胞鑒定:
(1)當(dāng)收到一株新的細(xì)胞株進(jìn)實驗室時；
(2)某細(xì)胞株需要長期凍存時，提前做；
(3)從細(xì)胞庫復(fù)蘇后，確認(rèn)是否為目標(biāo)細(xì)胞株；
(4)當(dāng)細(xì)胞株傳代超過5-10代后；
(5)當(dāng)研究數(shù)據(jù)出現(xiàn)異常，有疑問時；
(6)當(dāng)研究開始，準(zhǔn)備的細(xì)胞株；以及研究結(jié)束時，針對研究的細(xì)胞。
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鼠源STR鑒定采用小鼠基因分型試劑盒（Mouse STR v3.0）實現(xiàn)了建立小鼠細(xì)胞株分型圖譜，準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對、確定細(xì)胞株身份的同時，也可確認(rèn)是否存在人源細(xì)胞株交叉污染
提供樣本類型：細(xì)胞沉淀，細(xì)胞培養(yǎng)液，細(xì)胞凍存液，DNA，組織等(組織要大于芝麻粒大小；細(xì)胞大于等于106）
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一、小鼠細(xì)胞STR鑒定試驗流程：
STR自動化分型技術(shù)主要步驟：多色熒光標(biāo)記STR復(fù)合擴(kuò)增，擴(kuò)增產(chǎn)物自動毛細(xì)管電泳結(jié)合激光誘導(dǎo)的熒光檢測，自動數(shù)據(jù)采集并分型。
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1、樣本提供：細(xì)胞株細(xì)胞105-106個；組織樣本（至少芝麻粒大小，加冰袋運(yùn)輸）；
2、取適量檢材用Chelex100?提取DNA；
3、采用小鼠基因分型試劑盒（Mouse STR v3.0）對18-3、4-2、6-7、19-2、1-2、7-1、8-1、1-1、3-2、2-1、15-3和6-4等20個位點(diǎn)進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增（包括TH01、D5S818人源STR位點(diǎn)）；
4、使用ABI 3130XL型遺傳分析儀上對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測；
5、使用GeneMapper IDX軟件(Applied Biosystems)對檢測結(jié)果進(jìn)行分析，并與ATCC數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。
6、審核實驗報告，提供實驗報告給委托人或者企業(yè)單位。
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二、數(shù)據(jù)對比詳情（以樣本MC-18為例）：
1、本檢測體系的小鼠細(xì)胞STR檢測位點(diǎn)參考:Interlaboratory study to validate a STR profiling method for intraspecies identification of mouse cell lines. （June 20,2019）PLoS ONE
細(xì)胞mc-18的STR分型結(jié)果
Marker | Allele 1 | Allele 2 | Allele 3 | Allele 4 |
?18-3 | 15 | 16 | ? | ? |
?4-2 | 20.3 | 21.3 | ? | ? |
?6-7 | 15 | ? | ? | ? |
?19-2 | 13 | 14 | ? | ? |
?1-2 | 19 | 20 | ? | ? |
?7-1 | 26.2 | ? | ? | ? |
?8-1 | 16 | 17 | ? | ? |
?1-1 | 17 | 18 | 19 | ? |
?3-2 | 15 | 16 | ? | ? |
?2-1 | 16 | ? | ? | ? |
?15-3 | 22.3 | 23.3 | ? | ? |
?6-4 | 18 | 19 | ? | ? |
?13-1 | 17 | 18 | ? | ? |
?11-2 | 16 | 17 | ? | ? |
?17-2 | 15 | 16 | 17 | ? |
?12-1 | 17 | 18 | ? | ? |
?5-5 | 16 | 20 | ? | ? |
?X-1 | 28 | ? | ? | ? |
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2、圖譜
有效峰為真實的PCR條帶;小峰和非特異性條帶在計算中忽略不計
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①該株細(xì)胞DNA進(jìn)行小鼠細(xì)胞STR分型結(jié)果顯示，分型結(jié)果良好，1-1和17-2出現(xiàn)三等位基因現(xiàn)象，TH01、D5S818人源STR位點(diǎn)未見特異擴(kuò)增峰。
②該株細(xì)胞為單一來源小鼠細(xì)胞，且沒有人源細(xì)胞污染。
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STR分型圖譜說明：
（1）綠色橫條為對應(yīng)的STR基因座名稱；
（2）各STR基因座位置的對應(yīng)的灰色條帶為群體遺傳學(xué)分析統(tǒng)計的不同等位基因的標(biāo)準(zhǔn)品對應(yīng)的片段長度；
（3）橫坐標(biāo)為基因片段長度值范圍：圖譜顯示范圍一般為70b p-500bp；
（4）縱坐標(biāo)為STR基因片段的信號強(qiáng)度，峰值越高表示當(dāng)前檢測時的樣本相對濃度越高。
3、輸入待檢樣本的STR數(shù)據(jù)信息后給出對比結(jié)果
TUNEology 波長可調(diào)檢測卡盒-->