甲基化芯片850K
產品名稱： 甲基化芯片850K
英文名稱： methylation microarray
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產品價格： 詢價
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產品簡介
采用Illumina850公司的850K甲基化芯片對DNA甲基化情況進行檢測。Illumina850K甲基化芯片設計了850,000多個甲基化位點，全面覆蓋了95%的CpG島，99%的RefSeq Genes，保留450K芯片90%的位點外，還在增強子區域新增了350,000個甲基化位點（ENCODE enhancers，ENCODE open chromatin， >80% of FANTOM5 Enhancers，GENCODE genes, promoters, UTRs），所需要的DNA起始量低至250ng，兼容FFPE, 支持LIMS及自動化系統，包含三種規格試劑盒：16，32，96樣本。
應用領域
胚胎發育和組織分化，復雜疾病的發生、發展機制，環境因素（如激素、飲食、壓力、損傷等）對與甲基化修飾的關系。
技術流程
???????樣本質控??亞硫酸鹽處理??全基因組擴增及片段化??芯片雜交、洗脫、延伸、成像掃描??數據分析
產品參數
| 產品 | 策略 | 信息分析 | 項目周期 |
|---|---|---|---|
| 甲基化芯片 | Illumina Human Methylation 850K BeadChip | 標準分析 | 25個工作日 |
生物信息分析流程圖
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備注：可進行定制化分析
案例分享
案例一
Infinium HumanMethylation 450 BeadChip芯片分析結直腸癌全基因組甲基化模式[1]
使用Infinium HumanMethylation450 BeadChip 在22對結腸直腸癌（CRC）、癌旁組織和19個健康人的直腸組織樣本中進行全基因組的DNA甲基化分析，鑒定到15667個與結腸直腸癌相關的甲基化位點。通過分析確定了SND1, ADHFE1, OPLAH, TLX2, C1orf70, ZFP64, NR5A2和 COL4A幾個可靠的甲基化標記，且在大樣本得到驗證，有望作為結直腸癌的診斷標志物。
參考文獻
[1]Naumov, V. A., E. V. Generozov, N. B. Zaharjevskaya, D. S. Matushkina, A. K. Larin, S. V. Chernyshov, M. V. Alekseev, Y. A. Shelygin and V. M. Govorun. "Genome-Scale Analysis of DNA Methylation in Colorectal Cancer Using Infinium Humanmethylation450 Beadchips." Epigenetics 8, no. 9 (2013): 921-34.
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