環(huán)狀RNA測序
產(chǎn)品名稱： 環(huán)狀RNA測序
英文名稱： circRNA
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產(chǎn)品價格： 0
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環(huán)狀RNA測序
環(huán)狀RNA（circRNA）是一類特殊的非編碼RNA分子，也是RNA領(lǐng)域最新的研究熱點。與傳統(tǒng)的線性RNA（linear RNA，含5’和3’末端）不同，circRNA分子呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)，不受RNA外切酶影響，表達更穩(wěn)定，不易降解。近幾年的研究表明，circRNA在生物的生長發(fā)育、對外界環(huán)境的抵御等方面具有重要的調(diào)控作用。由于circRNA的閉合環(huán)狀特性，通過去除total RNA中的rRNA和線性RNA分子，可以特異地富集circRNA分子后測序，更有針對性地分析受檢樣本中特定的circRNA譜、circRNA剪接模式、組間差異和功能等。
歐易特色
● 應(yīng)用范圍廣：可以檢測幾乎任何動植物的環(huán)狀RNA
● 環(huán)狀RNA全覆蓋：高深度覆蓋，可以檢測到低豐度的稀有circRNA
● 專業(yè)化的生物信息學(xué)分析：強大的生物信息學(xué)團隊，提供新環(huán)狀RNA鑒定、環(huán)狀RNA功能預(yù)測、環(huán)狀RNA分子標志物篩選等深入分析易讀性強的數(shù)據(jù)報告
項目流程
獲取total RNA---RNase R?消化線性RNA---純化后去除rRNA---測序文庫構(gòu)建---上機測序---原始測序數(shù)據(jù)---數(shù)據(jù)質(zhì)控---數(shù)據(jù)分析
推薦測序模式
● Hiseq4000，PE150 ● 推薦10 Gb/樣本
樣品要求
● ≥22 μg（建庫需求量為20 μg） ● OD260/280為1.8-2.2
● 適用范圍：有參考基因組的真核生物
數(shù)據(jù)分析內(nèi)容
標準數(shù)據(jù)分析
● 原始測序數(shù)據(jù)質(zhì)控 ● 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估 ● Reads污染檢測 ● circRNA鑒定
● circRNA來源基因注釋 ● circRNA基因結(jié)構(gòu)分析 ● circRNA的表達豐度 ● circRNA差異表達分析
高級數(shù)據(jù)分析
● circRNA-miRNA互作分析、互作網(wǎng)絡(luò)圖繪制 ● ceRNA分析 ● WGCNA分析
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