標準Oligo合成
產品名稱: 標準Oligo合成
英文名稱: Oligo
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合成量(起始合成量) 25 nmol, 50 nmol, 0.2 μmol, 1.0 μmol, 10μmol, 15 μmol 最長合成長度 5~130mer 可選純化方法 Bio-RP, HPLC and PAGE Q.C & Q.A MALDI-TOF Mass Spectrometer & CE (Capillary Electrophoresis) 這里所說合成量指的是起始合成量,終產量根據如下因素所決定。合成的偶聯效率分別為99%、98%、97%時,30mer的最終濃度為(0.99)30=74%、(0.98)30=58%、(0.97)30=40%。合成長度越長最終得到的mer數越少。另外根據寡核苷酸序列不同耦合效率也不同,不能合成的極端情況也有可能發生。根據所選擇的純化方式不同最終的產量也會有差異,只做脫鹽時,沒有偶聯的n-1、n-2、n-3…mer長度的寡核苷酸各1-3%長度混合在里面,導致終產量較高。Bioneer的Bio-RP高純度純化可以去除所有合成失敗、修飾失敗、脫鹽失敗等質量偏差,合成結束后再打MALDI-TOP質譜,得到準確長度的寡核苷酸。 純化方式 可選擇Bio-RP、HPLC、PAGE等多種純化方式 Bioneer的Bio-RP純化方式不收取純化費用 隨時為客戶提供所需寡核苷酸純化方面的咨詢 Bio-RP純化 在合成過程中為了防止連續的偶聯反應,單體亞磷酰胺核苷的5’羥基基團被DMT基所保護。如果在合成的最后一個cycle結束后不把DMT基拿掉,合成結束后只有n-mer寡核苷酸上有5’DMT基,其他的副產物n-1、n-2、n-3…mer上沒有DMT基。DMT基具有疏水性,Bioneer研究團隊開發出了Bio-RP純化方法,RP resin可以和DMT緊密貼合。通過Bio-RP純化可以有效分離n-mer寡核苷酸,去除n-1、n-2、n-3…mer等副產物,得到高純度的n-mer寡核苷酸。 HPLC 在做Cloning, Site directed mutagenesis或者Quantitative gene detection等實驗時,需要高純度的寡核苷酸。這時脫鹽或者Bio-RP純化方式滿足不了實驗要求,為了得到高純度的寡核苷酸,通常選用HPLC純化方法。純化resin通常選用Anion-exchange resin 或者Reversed-phase resin。30mer左右的寡核苷酸用Anion-exchange resin純化,純度可以達到90%以上,Reversed-phase resin也能得到類似的純度。合成長度對HPLC純化純度影響很大,所以一般35mer以上不建議用次純化方式。 PAGE純化 長鏈合成通常選用PAGE純化,Polyacrylamide gel跑電泳一般可以分離到130mer左右的長度,純度95%以上。電泳方法分離效果雖然很好,但是為了得到寡核苷酸,后續還需要切膠提取再進行脫鹽處理,這樣會使得率有所損失。 根據應用選擇適當的純化方式 保證量 寡核苷酸的合成終產量根據堿基構成、純化方法、寡核苷酸長度、起始合成量及修飾不同會差異 Bioneer提供的寡核苷酸量最少不低于標準得率。 Synthesis Scales 最少得量O.D 25mer為基準 Bio-RP PAGE HPLC 0.025 μmole 2 1 1.5 0.05 μmole 4 2 2.5 0.2 μmole 8 6 7 1 μmole 30 18 25 10 μmole 300 33 - 15 μmole 咨詢 通過現有的DMT-monitoring QC, PAGE QC, HPLC QC等質檢方法,不可能知道失敗的合成及修飾成功率。 通過MALDI-TOF QC (Matrix-Assisted Laser Desorption / Ionization Time of Flight) mass spectrometer可以準確的測定分子量,與現有質檢方式不同,可以準確的保證合成的質量. 引入7臺MALDI- TOF質譜儀,所有合成均通過MALDI-TOF QC從而為客戶提供高品質合成。 提供MALDI-TOF QC的數據,方便客戶確認寡核苷酸的分子量。 50mer以上的長鏈合成通過HPCE (High Performance Capillary Electrophoresis) 'Oligo-pro?進行純度分析。 發貨時間 除PAGE純化以及修飾以外,所有普通合成當天下午3點前提交訂單,第二天從韓國發貨。貨物到上海后發送到客戶手中(江浙滬隔天到,其他區域2-3天,根據快遞情況可能有延遲情況發生)。
