SNP芯片/SNP檢測/SNP分型
產品名稱: SNP芯片/SNP檢測/SNP分型
英文名稱: Western Biotechnology Inc
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產品價格: 歡迎來電詳詢023-65316016,023—65316556
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更新時間: 2023-11-16T15:09:39
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Illumina 的高通量 SNP 芯片是基于 Infinium 技術的全基因組 SNP 檢測芯片(Infinium? Whole Genome Genotyping),適用于全基因組 SNP 分型研究及基因拷貝數變化研究,一張芯片檢測幾十萬標簽 SNP 位點,提供大規模疾病基因掃描。
SNP檢測
單核苷酸多態性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)是指基因組上單個核苷酸的變異,人類基因組平均每1000個就有一個SNP。它是由基因組DNA某一特定核苷酸位置上單個堿基的轉換、顛換、插入或缺失引起的點突變,使得群體之間和個體之間產生了差異。其中轉換和顛換發生頻率較高,轉換是指同型堿基之間的轉換,即嘌呤與嘌呤、嘧***與嘧***間;顛換是指發生在嘌呤與嘧***之間的替換。事實上轉換的發生頻率占多數,且CG序列上出現的SNP最為頻繁,而且多是C轉換為T,原因是CG中的C常因為甲基化自發地脫氨基后即成為T。
技術應用
SNP作為第三代遺傳標記,在復雜疾病的基因定位、關聯分析、個體疾病易感性分析與藥物基因組學的研究中發輝了重要的作用。除醫學研究外,SNP已逐漸涉及遺傳學、生態學、作物育種眾多鄰域。研究對象也由人類擴展到有重要經濟價值和研究價值的動植物、微生物等。
SNP分型檢測技術服務
SNP(single nucleotide polymophism),即單核苷酸多態,是由于單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態。一般來說,一個SNP位點只有兩種等位基因,因此又叫雙等位基因。SNP在人基因組中的發生頻率比較高,大約平均每1000個堿基中就有一個多態位點,是繼微衛星之后的第三代遺傳標記。有些SNP位點還會影響基因的功能,從而導致生物性狀改變甚至致病。?
SNP研究包括SNP發現(discovery)、SNP驗證(validation)以及SNP篩選(Screening or Scoring)。廣泛用于群體遺傳學研究(如生物的起源、進化及遷移等方面,將逐漸取代微衛星而成為新一代的分子生物學標記)。和疾病相關基因的研究,在藥物基因組學、診斷學和生物醫學研究中起重要作用。SNP的分布不均勻,非轉錄序列中要多于轉錄序列,絕大多數位于蛋白的非編碼區。雖然SNP不及RFLP和短串聯重復序列STR標記變異程度高,但由于數量巨大,分布頻密,因此就整體而言,其多態性要高得多。??
1.?直接測序法進行SNP分析
?在所有SNP的檢測方法中,對待檢測片段進行直接擴增、測序是最為準確的方法,也是SNP分析的金標準。通常情況下,純合型SNP位點的測序峰為單一峰型,而雜合型SNP位點的測序峰為套峰,因而很容易將其區分開來。通過直接測序方法進行SNP檢測的檢出率接近100%。
1)操作流程:
2)樣品要求:
血液樣品:樣品為EDTA抗凝或枸椽酸鈉抗凝,樣品量大于1ml,樣品采集后于-20℃或-80℃保存;
組織樣品:樣品可以為新鮮組織(最好-80℃保存)、石蠟包埋組織或95%乙醇中固定的組織,組織量大于50μg 細胞、菌液等。
3)提供結果:
實驗流程、電泳圖、測序圖譜、SNP基因型統計結果等。
2.Taqman探針法(定量PCR)
客戶根據實驗要求挑選出SNPs后,提交給我們進行引物與探針設計與合成。上述工作完成后,客戶提供2ug的DNA樣品,經確認樣品質量合格我們即可進行實驗。
1)技術特點:
適合位點數量少,樣本通量高的檢測(每個位點需要合成兩條探針,探針合成費用高);
應用ABI7900、ABI7500定量PCR儀進行定量檢測;
操作簡便,只需一步 PCR 反應,無須進行純化和預處理,直接上機檢測;
結果清晰,軟件分析結果界面友好,標出了每個樣本的基因型及熒光強度,非常直觀;
可采用ABI合成的探針或國產探針。
2)樣品要求:同測序法。
3)提供結果:實驗流程、電泳圖、定量PCR結果、統計分析結果等。

