RNA干擾服務
產品名稱: RNA干擾服務
英文名稱: RNA interfering,RNAi
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RNA干擾(RNA interfering,RNAi)現象是由與靶基因序列同源的雙鏈RNA引發的廣泛存在于生物體內的序列特異性基因轉錄后的沉默過程。由于RNAi具有高度的序列專一性和有效的干擾,可以特異地將特定的基因沉默,從而獲得基因功能喪失或基因表達量的降低,因此可以作為功能基因組學的一種強有力的研究工具。RNAi技術可廣泛應用到包括功能學,藥物靶點篩選,細胞信號傳導通路分析,疾病治療等等。我們可對靶基因序列進行干擾位置效應評價和序列同源型分析,完成siRNA/shRNA/miRNA等多種序列的設計,并提供從siRNA合成、RNAi載體構建到RNAi相關的病毒包裝、RNAi功能驗證等全面的RNAi解決方案。 ※ RNAi服務類別 1、siRNA 對于瞬時基因沉默實驗,化學合成siRNA的方法操作簡便,容易獲得高水平的瞬時沉默效果,特異性強。我們通過嚴格設計來增強siRNA的專一性;針對某靶基因設計的3條siRNA可保證其中兩條的Knockdown效率達到70%(在轉染效率大于80%的情況下)。 1.1 普通siRNA:均由HPLC純化,100%除去尚未配對的單鏈 1.2 化學修飾siRNA:利用2’-Fluoro或2’-OMe修飾以提高siRNA在血清和培養基中的穩定性;作用時間長于普通siRNA 1.3 熒光標記siRNA 2、RNAi載體 RNAi載體表達可以長時間穩定地研究基因功能,載體在細胞中持續抑制靶基因的表達可達數星期甚至更久。 miR-RNAi載體構建-利用細胞內源性的miRNA加工機制,相比傳統shRNA載體可更高效地表達RNA發夾結構,并具有采用EmGFP進行表達追蹤和順式表達多個miRNA的優點。針對人類、大鼠、小鼠的大多數基因預先設計好了miR RNAi序列,每個基因設計的4條 miR RNAi Select序列我們保證至少有2條可以達到至少70%轉錄水平的knockdown(在轉染效率>80%的前提下)。 2.2 shRNA載體構建—設計針對特定基因的shRNA序列,并將其連入組成型pENTR?/U6或誘導型pENTR?/H1/TO載體中。 3、RNAi導入優化 由于siRNAs是進入細胞后才能對蛋白的表達進行抑制,因此如何高效地將siRNAs轉入細胞也是成功抑制基因表達的關鍵步驟。例如,一個siRNA分子對某特定基因的抑制效率為90%,而轉染效率為10%,那么最后抑制蛋白表達最后的效率只有9%,可見如何提高siRNAs的導入效率非常重要。 3.1 RNAi轉染優化-為了使得RNAi實驗獲得最大化的干擾效果,利用脂質體轉染試劑技術,針對多種真核生物細胞進行轉染參數的優化。RNAi 熒光標記的陰性對照、陽性對照可以用于進行轉染效率的優化。 3.2 病毒侵染優化-針對難于轉染細胞(特別是神經細胞、懸浮細胞、干細胞)和In vivo實驗,基于的RNAi病毒載體構建、包裝、濃縮等技術,利用腺病毒或慢病毒進行RNAi研究 3.3 篩選RNAi穩定細胞株-利用抗生素來篩選穩定表達shRNA或miRNA的細胞株 4、RNAi干擾效果檢測 用實時定量PCR方法檢測mRNA水平的基因敲減效果;通過Wester blot方法檢測蛋白水平的基因敲減效果
