精品推薦 | 雙管齊下,miRNA表達分析變得更加簡單
MicroRNAs(miRNAs)是一種大小約21-23個堿基的單鏈小分子RNA,是由具有發夾結構的約70-90個堿基大小的單鏈RNA前體經過Dicer酶加工后生成。miRNA主要與靶基因mRNA3‘端非編碼區域特異性結合,調控轉錄后靶基因mRNA的翻譯過程,從而阻斷mRNA翻譯和促進mRNA降解導致蛋白質表達降低。miRNA的作用涉及個體發育、組織分化、細胞增殖和細胞凋亡等多種心血管疾病的發生發展。

圖1.miRNA體內合成示意
成熟的miRNA的長度只有20nt左右,通常正向引物就會覆蓋其全長甚至會有多余部分,反向引物就無處安置了。目前市面上解決方案就是在反轉錄時設法增加反轉錄產物長度。常見的方法有加尾法和莖環法。
加尾法利用PolyA 聚合酶為成熟的miRNA加上Poly(A)尾,以帶有通用序列的Oligo-dT作為反轉錄引物,合成加長miRNA對應的cDNA第一鏈。莖環法以折疊為莖環結構的通用序列作為引物合成加長miRNA對應的cDNA第一鏈,后續擴增過程中,莖環結構在適宜的溫度下會被打開,和相關擴增引物結合。
圖2. 加尾法合成miRNA
圖3.莖環法合成miRNA

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? 產品推薦 ?
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? 翌圣miRNA加尾法反轉定量組合(11148ES&11171ES) ?
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11148ES-Hifair? miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit(加 A 法)
試劑盒采用加尾法來進行miRNA第一鏈cDNA的反轉錄,產品中的2×Hifair? miRNA RT buffer包含了miRNA加尾反應和反轉錄反應的所有原料和引物,并經過精心優化,可保證miRNA 3‘末端的Poly(A)修飾過程和反轉錄過程同時高效進行。

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? 11171ES-Hieff? miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix(加A法) ?
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專門為miRNA定量檢測而研發的新一代預混形式的熒光定量PCR檢測試劑,含有特殊的ROX Passive Reference Dye,適用于所有qPCR儀器,無需在不同的儀器上調整ROX的濃度,只需在配制反應體系時加入引物和模板即可進行擴增。DNA 聚合酶采用化學修飾的熱啟動聚合酶,配合特殊的Buffer體系,使反應特異性更好,靈敏度更高,并能在更廣的范圍內進行準確定量。
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? 可兼容全平臺qPCR儀器
圖.以293T細胞的Total RNA為模板,用Hifair? miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES)進行反轉錄,獲得的cDNA稀釋10倍后,用Hieff? miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES)分別檢測hsa-miR-let-7b-5p、hsa-miR-let-7c-5p、U6內參基因。
? 檢出率高,最高可達10 pg
圖. 以人工合成hsa-miR-let-7e-5p(a)和293T細胞Total RNA(b)為模板,分別稀釋成以下梯度:60拷貝到606拷貝(6個梯度)和10 pg-100 ng(5個梯度),用Hifair?miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES)進行反轉錄,獲得的cDNA用Hieff? miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES)檢測hsa-miR-let-7e-5p基因表達情況。
? 高特異性,能區分同家族miRNA間單堿基差異
圖. 人類hsa-let-7家族擁有多條miRNA,彼此間相差的堿基很少,甚至只有單堿基的差異。每個Let-7亞型(hsa-miR-let-7a~Let-7i,has-miR-98)的人工合成miRNA使用 Hifair?miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES)進行反轉錄合成cDNA,以不用的引物,用Hieff?miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES)分別擴增這些miRNA,利用公式2-ΔCTx 100%計算匹配率。結果顯示,可有效區分密切相關的亞型家族成員。
? 擴增效率出色

圖. 以人293T細胞和鼠源肝臟Total RNA為模板,擴增miR-let-7b-5p、miR-let-7c-5p、miR-let-7e-5p、miR-let-7f-5p基因。結果顯示,與同類產品相比,Hifair?miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES)配套 Hieff? miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES)的反應體系,具有優異的表現。
? 穩定性優秀,在 37℃穩定7天或凍融50次或配置體系在25℃保留48 h,效果依舊穩定


圖. 以293T細胞Total RNA為模板用Hifair? miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat# 11148ES) 進行反轉錄,獲得的cDNA稀釋10倍,用Hieff? miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix (Cat# 11171ES) 檢測hsa-miR-let-7b-5p、hsa-miR-let-7c-5p、hsa-miR-let-7e-5p的表達情況。△Ct<0.5。
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翌圣miRNA莖環法反轉定量組合(11139ES&11170ES)
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11139ES-Hifair? III 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus)
該試劑盒基于Hifair? III Reverse Transcriptase而開發。該酶cDNA合成速度快,且熱穩定性大幅度提高,可耐受高達60℃的反應溫度,適合具有復雜二級結構的RNA模板的反轉錄。同時,該酶增強了與模板的親和力,適合少量模板以及低拷貝基因的反轉錄。Hifair? III Reverse Transcriptase合成全長cDNA的能力也有了提升,可合成長達19.8 kb的cDNA。
11170ES-Hieff? miRNA Universal qPCR SYBR Master Mix(莖環法)
本產品是使用SYBR Green I嵌合熒光法進行miRNA定量反應的專用預混液。由于miRNA序列短,且同一家族的miRNA序列往往高度相近,故在定量時對特異性要求極高。本品基于熱啟動的 DNA 聚合酶,配以優化的Buffer,能夠極大地減少非特異性擴增;同時,特殊的ROX Reference Dye,使得預混液適應于所有qPCR儀器,無需在不同的儀器上調整ROX濃度,只需在配制反應體系時加入引物和模板即可進行擴增。
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