日前，由北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司主辦，BD（中國）作為金牌贊助的2018單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)用研討會(huì)在北京希爾頓逸林酒店成功舉辦。
大會(huì)參會(huì)人員合影
本次大會(huì)分為兩部分：第一部分：由八位單細(xì)胞領(lǐng)域權(quán)威專家作為大會(huì)報(bào)告嘉賓，圍繞單細(xì)胞測序技術(shù)在干細(xì)胞領(lǐng)域、腫瘤領(lǐng)域、發(fā)育、心血管疾病、生殖領(lǐng)域等應(yīng)用方向進(jìn)行專題報(bào)告；第二部分：由博奧晶典的生物信息工程師為參會(huì)學(xué)者分享了數(shù)據(jù)分析的常用軟件和晶典在眾多實(shí)戰(zhàn)項(xiàng)目中的經(jīng)驗(yàn)。為國內(nèi)廣大單細(xì)胞研究的科研學(xué)者提供了相互交流的高質(zhì)量平臺(tái)，為單細(xì)胞前沿技術(shù)在生物科技領(lǐng)域的探索實(shí)踐做了高效推動(dòng)。
近300名代表參加本次會(huì)議
總共有來自北京、天津、河北、上海、河南、山東、浙江、江蘇、福建、廣東、湖南、湖北、黑龍江、遼寧、陜西15個(gè)省市，21所大學(xué)、26家研究機(jī)構(gòu)、34家醫(yī)院的近300位參會(huì)嘉賓出席本次會(huì)議。
北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司首席執(zhí)行官許俊泉進(jìn)行開幕式致辭
北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司首席執(zhí)行官許俊泉先生為本次會(huì)議進(jìn)行了開幕式致辭。許俊泉先生表示單細(xì)胞測序技術(shù)作為探索細(xì)胞異質(zhì)性的革命性技術(shù)，為基礎(chǔ)研究和臨床應(yīng)用帶來了新的展望。借此機(jī)會(huì)，博奧晶典舉辦本次盛會(huì)，旨在為國內(nèi)單細(xì)胞測序技術(shù)開發(fā)和應(yīng)用的科研學(xué)者提供相互交流的平臺(tái)。
大會(huì)報(bào)告精彩回顧
鄧宏魁 教授
北京大學(xué)博雅講席教授、長江特聘教授，北京大學(xué)干細(xì)胞研究中心主任鄧宏魁教授作了題為“化學(xué)小分子操控和重塑細(xì)胞命運(yùn)”的專題報(bào)告。鄧教授在報(bào)告中詳細(xì)介紹了課題組在體細(xì)胞重編程研究領(lǐng)域的系列工作，以及使用10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了體細(xì)胞重編程過程中一個(gè)新的中間狀態(tài)的細(xì)胞類型，該細(xì)胞亞群具有兩細(xì)胞（2C）胚胎樣轉(zhuǎn)錄特征，并闡述了其在細(xì)胞多能性獲得中的關(guān)鍵作用，相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在國際干細(xì)胞頂級(jí)雜志《Cell Stem Cell》，【詳情請(qǐng)閱讀：重磅 ∣ 10X Genomics又一力作，博奧晶典聯(lián)合北京大學(xué)體細(xì)胞重編程機(jī)制研究登頂《Cell Stem Cell》】
北京大學(xué)博雅講席教授、長江特聘教授，北京大學(xué)干細(xì)胞研究中心主任鄧宏魁教授作了題為“化學(xué)小分子操控和重塑細(xì)胞命運(yùn)”的專題報(bào)告。鄧教授在報(bào)告中詳細(xì)介紹了課題組在體細(xì)胞重編程研究領(lǐng)域的系列工作，以及使用10X Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了體細(xì)胞重編程過程中一個(gè)新的中間狀態(tài)的細(xì)胞類型，該細(xì)胞亞群具有兩細(xì)胞（2C）胚胎樣轉(zhuǎn)錄特征，并闡述了其在細(xì)胞多能性獲得中的關(guān)鍵作用，相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在國際干細(xì)胞頂級(jí)雜志《Cell Stem Cell》，【詳情請(qǐng)閱讀：重磅 ∣ 10X Genomics又一力作，博奧晶典聯(lián)合北京大學(xué)體細(xì)胞重編程機(jī)制研究登頂《Cell Stem Cell》】
潘星華 教授
廣州南方醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)特聘教授、廣東省單細(xì)胞技術(shù)與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任，兼任美國耶魯大學(xué)遺傳系顧問潘星華教授在大會(huì)上做了題為“單細(xì)胞測序的進(jìn)展和前景”的專題報(bào)告。潘教授對(duì)目前單細(xì)胞測序在基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組的方法做了詳細(xì)的綜述，總結(jié)近年來單細(xì)胞測序技術(shù)在干細(xì)胞、癌癥、免疫、神經(jīng)和發(fā)育等領(lǐng)域應(yīng)用所產(chǎn)生的一些重大成果。潘教授課題組在單細(xì)胞測序技術(shù)的研發(fā)和應(yīng)用上碩果累累，報(bào)告期間展示了他們的部分成果。此外，潘教授陳述了單細(xì)胞測序目前所面臨的一些瓶頸和挑戰(zhàn)，為我們將來使用單細(xì)胞測序技術(shù)更好的服務(wù)于基礎(chǔ)研究和臨床應(yīng)用做了新的展望。
廣州南方醫(yī)科大學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)特聘教授、廣東省單細(xì)胞技術(shù)與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任，兼任美國耶魯大學(xué)遺傳系顧問潘星華教授在大會(huì)上做了題為“單細(xì)胞測序的進(jìn)展和前景”的專題報(bào)告。潘教授對(duì)目前單細(xì)胞測序在基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組的方法做了詳細(xì)的綜述，總結(jié)近年來單細(xì)胞測序技術(shù)在干細(xì)胞、癌癥、免疫、神經(jīng)和發(fā)育等領(lǐng)域應(yīng)用所產(chǎn)生的一些重大成果。潘教授課題組在單細(xì)胞測序技術(shù)的研發(fā)和應(yīng)用上碩果累累，報(bào)告期間展示了他們的部分成果。此外，潘教授陳述了單細(xì)胞測序目前所面臨的一些瓶頸和挑戰(zhàn)，為我們將來使用單細(xì)胞測序技術(shù)更好的服務(wù)于基礎(chǔ)研究和臨床應(yīng)用做了新的展望。
蔡濤 主任
北京生命科學(xué)研究所測序中心主任，北京市“海聚工程專家人才”，蔡濤主任做了題為“肺泡發(fā)育中新細(xì)胞類型的鑒定”的報(bào)告。蔡濤主任在報(bào)告中詳細(xì)介紹了使用10X genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在研究小鼠肺泡I型細(xì)胞發(fā)育中獲得的新發(fā)現(xiàn)，相關(guān)的研究結(jié)果發(fā)表在《PNAS》?！驹斍檎?qǐng)閱讀：《PNAS》博奧晶典助力國內(nèi)科研人員應(yīng)用10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)解析肺泡一型細(xì)胞亞型異質(zhì)性。】并且，為參會(huì)嘉賓總結(jié)了做單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中的一些經(jīng)驗(yàn)和教訓(xùn)，如：細(xì)胞質(zhì)量將直接影響結(jié)果的好壞，在開展單細(xì)胞的研究中應(yīng)盡量避免混樣，控制因細(xì)胞混合帶來的復(fù)雜地?cái)?shù)據(jù)解析過程。
王文會(huì) 副教授
清華大學(xué)副教授、青年千人王文會(huì)博士做了題為“用于單細(xì)胞操作與分析的微器件和系統(tǒng)”的報(bào)告。王文會(huì)博士詳細(xì)介紹了其課題組結(jié)合微器件與顯微操作系統(tǒng)，對(duì)細(xì)胞等微米級(jí)的對(duì)象進(jìn)行操作的相關(guān)工作和進(jìn)展。包括細(xì)胞注射/取放系統(tǒng)、細(xì)胞力/粘附測量、細(xì)胞三維旋轉(zhuǎn)/成像/ 機(jī)電特性測量、細(xì)胞捕獲與圖形化等。通過這些操作實(shí)例，展示出微器件與系統(tǒng)在研究單細(xì)胞的巨大潛能，為其他老師對(duì)單個(gè)細(xì)胞的研究開拓了更多的思路和方向。
清華大學(xué)副教授、青年千人王文會(huì)博士做了題為“用于單細(xì)胞操作與分析的微器件和系統(tǒng)”的報(bào)告。王文會(huì)博士詳細(xì)介紹了其課題組結(jié)合微器件與顯微操作系統(tǒng)，對(duì)細(xì)胞等微米級(jí)的對(duì)象進(jìn)行操作的相關(guān)工作和進(jìn)展。包括細(xì)胞注射/取放系統(tǒng)、細(xì)胞力/粘附測量、細(xì)胞三維旋轉(zhuǎn)/成像/ 機(jī)電特性測量、細(xì)胞捕獲與圖形化等。通過這些操作實(shí)例，展示出微器件與系統(tǒng)在研究單細(xì)胞的巨大潛能，為其他老師對(duì)單個(gè)細(xì)胞的研究開拓了更多的思路和方向。
文路 副研究員
來自北京大學(xué)湯富酬教授課題組的文路博士為我們帶來了“單細(xì)胞多重組學(xué)測序新技術(shù)及其應(yīng)用”的報(bào)告。文路博士介紹了其課題組開發(fā)的一種單細(xì)胞表觀基因組平行多組學(xué)測序技術(shù)scCOOL-Seq,該技術(shù)可以同時(shí)對(duì)單細(xì)胞進(jìn)行染色質(zhì)狀態(tài)、DNA甲基化和基因組拷貝數(shù)變異等多組學(xué)層面分析，并介紹了使用該技術(shù)在小鼠與人類著床前胚胎發(fā)育過程進(jìn)行的研究成果。此外，文路博士還介紹了另一種單細(xì)胞三重組學(xué)測序技術(shù) scTrio-Seq，它能夠從一個(gè)單細(xì)胞中同時(shí)獲取基因組拷貝數(shù)變異、DNA甲基化組和轉(zhuǎn)錄組三層面組學(xué)信息，并分享了其應(yīng)用于分析肝癌與結(jié)直腸癌腫瘤異質(zhì)性的研究結(jié)果。通過實(shí)際應(yīng)用案例，為各位老師開展單細(xì)胞多組學(xué)研究提供了新的方法。
來自北京大學(xué)湯富酬教授課題組的文路博士為我們帶來了“單細(xì)胞多重組學(xué)測序新技術(shù)及其應(yīng)用”的報(bào)告。文路博士介紹了其課題組開發(fā)的一種單細(xì)胞表觀基因組平行多組學(xué)測序技術(shù)scCOOL-Seq,該技術(shù)可以同時(shí)對(duì)單細(xì)胞進(jìn)行染色質(zhì)狀態(tài)、DNA甲基化和基因組拷貝數(shù)變異等多組學(xué)層面分析，并介紹了使用該技術(shù)在小鼠與人類著床前胚胎發(fā)育過程進(jìn)行的研究成果。此外，文路博士還介紹了另一種單細(xì)胞三重組學(xué)測序技術(shù) scTrio-Seq，它能夠從一個(gè)單細(xì)胞中同時(shí)獲取基因組拷貝數(shù)變異、DNA甲基化組和轉(zhuǎn)錄組三層面組學(xué)信息，并分享了其應(yīng)用于分析肝癌與結(jié)直腸癌腫瘤異質(zhì)性的研究結(jié)果。通過實(shí)際應(yīng)用案例，為各位老師開展單細(xì)胞多組學(xué)研究提供了新的方法。
聶宇 副研究員
中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院阜外醫(yī)院，心血管疾病國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，副研究員聶宇博士做了題為“單細(xì)胞測序解析心肌再生分子機(jī)制”的報(bào)告。聶宇博士通過風(fēng)趣幽默的語言介紹了為什么要開展心肌再生的研究，該研究在臨床治療的重大意義，以及他們?cè)谠擃I(lǐng)域所取得的重要成果。最后，介紹了他們使用單細(xì)胞測序技術(shù)在心肌再生機(jī)制研究方面目前所取得的進(jìn)展。
中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院阜外醫(yī)院，心血管疾病國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，副研究員聶宇博士做了題為“單細(xì)胞測序解析心肌再生分子機(jī)制”的報(bào)告。聶宇博士通過風(fēng)趣幽默的語言介紹了為什么要開展心肌再生的研究，該研究在臨床治療的重大意義，以及他們?cè)谠擃I(lǐng)域所取得的重要成果。最后，介紹了他們使用單細(xì)胞測序技術(shù)在心肌再生機(jī)制研究方面目前所取得的進(jìn)展。
林巍 博士
達(dá)拉斯貝勒醫(yī)學(xué)中心免疫研究所(BIIR@Dallas, TX)基因組學(xué)和生物信息學(xué)研究室主任、亞利桑那轉(zhuǎn)化基因組研究所 (TGen@Phoenix, AZ) 資深顧問林巍博士主要從事單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析內(nèi)容的開發(fā)工作。林巍博士的報(bào)告對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的當(dāng)前分析策略進(jìn)行總結(jié)，尤其是結(jié)合其團(tuán)隊(duì)所開發(fā)的監(jiān)督學(xué)習(xí)細(xì)胞分型方法以及已有的非監(jiān)督聚類和細(xì)胞時(shí)序軌跡分析方法，提出了推進(jìn)的單細(xì)胞多譜系和目標(biāo)譜系的分析路線圖。在展示該分析路線過程中，他以高度異質(zhì)化的腫瘤組織為例進(jìn)行深度解析。首先將腫瘤細(xì)胞和微環(huán)境細(xì)胞區(qū)分出來并揭示其相互作用、以及富集的信號(hào)通路。在此基礎(chǔ)上，對(duì)于腫瘤細(xì)胞譜系的演化特點(diǎn)做更為細(xì)致分析。通過對(duì)腫瘤細(xì)胞的時(shí)序軌跡分析，展示了大量推進(jìn)腫瘤 EMT 轉(zhuǎn)化基因。
達(dá)拉斯貝勒醫(yī)學(xué)中心免疫研究所(BIIR@Dallas, TX)基因組學(xué)和生物信息學(xué)研究室主任、亞利桑那轉(zhuǎn)化基因組研究所 (TGen@Phoenix, AZ) 資深顧問林巍博士主要從事單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析內(nèi)容的開發(fā)工作。林巍博士的報(bào)告對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的當(dāng)前分析策略進(jìn)行總結(jié)，尤其是結(jié)合其團(tuán)隊(duì)所開發(fā)的監(jiān)督學(xué)習(xí)細(xì)胞分型方法以及已有的非監(jiān)督聚類和細(xì)胞時(shí)序軌跡分析方法，提出了推進(jìn)的單細(xì)胞多譜系和目標(biāo)譜系的分析路線圖。在展示該分析路線過程中，他以高度異質(zhì)化的腫瘤組織為例進(jìn)行深度解析。首先將腫瘤細(xì)胞和微環(huán)境細(xì)胞區(qū)分出來并揭示其相互作用、以及富集的信號(hào)通路。在此基礎(chǔ)上，對(duì)于腫瘤細(xì)胞譜系的演化特點(diǎn)做更為細(xì)致分析。通過對(duì)腫瘤細(xì)胞的時(shí)序軌跡分析，展示了大量推進(jìn)腫瘤 EMT 轉(zhuǎn)化基因。
張怡然 博士
生物芯片北京國家工程研究中心健康科學(xué)研究院張怡然博士，進(jìn)行了題為“單細(xì)胞測序技術(shù)與肺癌細(xì)胞圖譜研究”的報(bào)告。張怡然博士詳細(xì)介紹了他們搭建的一套針對(duì)肺癌病人外周血及胸水CTCs 的分離檢測流程，通過單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)，發(fā)現(xiàn)與正常組織相比CTCs 存在特異表達(dá)基因，進(jìn)一步轉(zhuǎn)錄因子富集分析發(fā)現(xiàn)，這些特異表達(dá)基因被干細(xì)胞因子所調(diào)控。利用這些信息，向腫瘤培養(yǎng)基中添加維持干性的細(xì)胞因子，使腫瘤原代培養(yǎng)的成功率大幅提高，并且在短時(shí)間內(nèi)可以獲得大量腫瘤細(xì)胞進(jìn)行體外的藥物敏感性測試，為臨床提供了寶貴的信息。
生物芯片北京國家工程研究中心健康科學(xué)研究院張怡然博士，進(jìn)行了題為“單細(xì)胞測序技術(shù)與肺癌細(xì)胞圖譜研究”的報(bào)告。張怡然博士詳細(xì)介紹了他們搭建的一套針對(duì)肺癌病人外周血及胸水CTCs 的分離檢測流程，通過單細(xì)胞多組學(xué)測序技術(shù)，發(fā)現(xiàn)與正常組織相比CTCs 存在特異表達(dá)基因，進(jìn)一步轉(zhuǎn)錄因子富集分析發(fā)現(xiàn)，這些特異表達(dá)基因被干細(xì)胞因子所調(diào)控。利用這些信息，向腫瘤培養(yǎng)基中添加維持干性的細(xì)胞因子，使腫瘤原代培養(yǎng)的成功率大幅提高，并且在短時(shí)間內(nèi)可以獲得大量腫瘤細(xì)胞進(jìn)行體外的藥物敏感性測試，為臨床提供了寶貴的信息。
數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班精彩呈現(xiàn)
單細(xì)胞測序后往往拿到每個(gè)樣品幾百G的數(shù)據(jù)量，如何從這些大規(guī)模的數(shù)據(jù)中更有效的挖掘數(shù)據(jù)，整理數(shù)據(jù)十分重要。來自博奧晶典的生物信息工程師方彬彬分享了：對(duì)單細(xì)胞測序技術(shù)在實(shí)際科研中的應(yīng)用，在實(shí)驗(yàn)開展期間數(shù)據(jù)分析和挖掘過程中的難點(diǎn)問題進(jìn)行了全方面經(jīng)驗(yàn)分享，參會(huì)嘉賓對(duì)培訓(xùn)內(nèi)容的干貨分享表示了高度認(rèn)可。
博奧晶典生物信息分析工程師 方彬彬
會(huì)議持續(xù)到晚上8點(diǎn)，參會(huì)嘉賓的熱情依然高漲。
培訓(xùn)班現(xiàn)場的火爆場面
2018單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)用研討會(huì)借此圓滿結(jié)束，會(huì)議圍繞著單細(xì)胞測序探討了其在干細(xì)胞、再生、發(fā)育、分化等領(lǐng)域的應(yīng)用，討論了單細(xì)胞測序研究的方法現(xiàn)狀并做了未來展望。作為生命科學(xué)領(lǐng)域高速發(fā)展的特色技術(shù)，我們也期待它更多的應(yīng)用到科研領(lǐng)域研究，更低的成本消耗，為基礎(chǔ)科研和臨床應(yīng)用帶來更多的成果！
博奧晶典致力于大規(guī)模單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)用的打磨，取百家之長，成為國內(nèi)最有品質(zhì)保障和經(jīng)驗(yàn)護(hù)航的單細(xì)胞測序優(yōu)質(zhì)服務(wù)商。下附博奧晶典單細(xì)胞測序產(chǎn)品列表：
博奧晶典致力于大規(guī)模單細(xì)胞測序技術(shù)應(yīng)用的打磨，取百家之長，成為國內(nèi)最有品質(zhì)保障和經(jīng)驗(yàn)護(hù)航的單細(xì)胞測序優(yōu)質(zhì)服務(wù)商。下附博奧晶典單細(xì)胞測序產(chǎn)品列表：
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